More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0728 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 		 645 aa  1296    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  58.82 
 
 		 669 aa  738    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  59.31 
 
 		 637 aa  698    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  61.8 
 
 		 649 aa  765    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  62.75 
 
 		 623 aa  778    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  57.72 
 
 		 637 aa  725    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  56.52 
 
 		 626 aa  703    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  59.15 
 
 		 623 aa  680    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  52.19 
 
 		 621 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  59.81 
 
 		 612 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  59.59 
 
 		 626 aa  738    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  63.76 
 
 		 652 aa  789    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  59.84 
 
 		 649 aa  741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  59.22 
 
 		 649 aa  716    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  60.22 
 
 		 643 aa  728    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  51.05 
 
 		 660 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  53.52 
 
 		 644 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  50.16 
 
 		 623 aa  623  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  52.1 
 
 		 624 aa  619  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  51.51 
 
 		 654 aa  618  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  44.63 
 
 		 644 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  44.48 
 
 		 644 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  44.48 
 
 		 644 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  44.33 
 
 		 644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  44.8 
 
 		 644 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  44.48 
 
 		 644 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  51.16 
 
 		 664 aa  571  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  46.98 
 
 		 645 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  46.22 
 
 		 645 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  45.32 
 
 		 623 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  45.24 
 
 		 623 aa  552  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  45.22 
 
 		 645 aa  555  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  47.9 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  41.12 
 
 		 639 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  45.44 
 
 		 616 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  45.27 
 
 		 653 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  45.13 
 
 		 616 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  44.41 
 
 		 612 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  45.45 
 
 		 646 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46.87 
 
 		 643 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  44.15 
 
 		 620 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  45.79 
 
 		 646 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46.53 
 
 		 643 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  44.9 
 
 		 607 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  44.92 
 
 		 607 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  40.76 
 
 		 638 aa  500  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  47.87 
 
 		 643 aa  499  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  44.76 
 
 		 607 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.38 
 
 		 648 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.85 
 
 		 609 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  45.34 
 
 		 614 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  48.55 
 
 		 648 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  44.7 
 
 		 659 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  48.38 
 
 		 648 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  45.23 
 
 		 627 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  45.19 
 
 		 614 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  45.02 
 
 		 612 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  43.51 
 
 		 607 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  43.97 
 
 		 649 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  46.12 
 
 		 646 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  45.96 
 
 		 646 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  46.12 
 
 		 661 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  46.12 
 
 		 661 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  46.12 
 
 		 646 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  44.01 
 
 		 618 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  45.17 
 
 		 657 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  46.12 
 
 		 646 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  46.12 
 
 		 646 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  43.96 
 
 		 622 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  45.41 
 
 		 667 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  44.27 
 
 		 627 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  44.72 
 
 		 627 aa  472  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.02 
 
 		 627 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  45.34 
 
 		 636 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  45.65 
 
 		 627 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.43 
 
 		 627 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  44.08 
 
 		 610 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  45.04 
 
 		 627 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.04 
 
 		 627 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  45.09 
 
 		 638 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  39.28 
 
 		 613 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  42.17 
 
 		 621 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  41.4 
 
 		 624 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  40.44 
 
 		 622 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  40.18 
 
 		 623 aa  398  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.76 
 
 		 924 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  42.51 
 
 		 616 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  30 
 
 		 595 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30.19 
 
 		 595 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 595 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 600 aa  213  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  30.48 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.96 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.75 
 
 		 535 aa  181  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.94 
 
 		 563 aa  181  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.64 
 
 		 566 aa  180  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.66 
 
 		 557 aa  178  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6128  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.72 
 
 		 579 aa  177  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.29 
 
 		 576 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.8 
 
 		 586 aa  174  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>