More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3495 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  64.34 
 
 		 644 aa  872    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  62.64 
 
 		 643 aa  801    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  100 
 
 		 645 aa  1335    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  64.34 
 
 		 644 aa  872    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  64.19 
 
 		 644 aa  868    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  63.88 
 
 		 644 aa  871    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  51.79 
 
 		 623 aa  658    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  51.32 
 
 		 623 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  94.88 
 
 		 645 aa  1273    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  63.72 
 
 		 644 aa  867    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  80.16 
 
 		 645 aa  1063    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  68.58 
 
 		 646 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  64.34 
 
 		 644 aa  872    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  60.16 
 
 		 643 aa  747    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  58.81 
 
 		 639 aa  797    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  70.12 
 
 		 645 aa  928    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  60.78 
 
 		 648 aa  778    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  61.15 
 
 		 648 aa  777    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  74.61 
 
 		 646 aa  965    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  62.79 
 
 		 643 aa  810    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  61.15 
 
 		 648 aa  777    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  58.29 
 
 		 638 aa  786    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  49.04 
 
 		 626 aa  601  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  45.31 
 
 		 623 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  47.6 
 
 		 623 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.2 
 
 		 612 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  45.71 
 
 		 669 aa  569  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  49.77 
 
 		 623 aa  568  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  44.51 
 
 		 621 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  46.64 
 
 		 649 aa  558  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.29 
 
 		 626 aa  555  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  47.92 
 
 		 637 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  45.83 
 
 		 624 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  45.94 
 
 		 649 aa  547  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  46.22 
 
 		 645 aa  537  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  46.21 
 
 		 652 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  46.48 
 
 		 643 aa  527  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  46.59 
 
 		 637 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 649 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  43.79 
 
 		 620 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  44.87 
 
 		 607 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  44.78 
 
 		 607 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  44.8 
 
 		 612 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  43.19 
 
 		 664 aa  501  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  45.6 
 
 		 607 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  45.69 
 
 		 607 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  43.54 
 
 		 644 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  43.89 
 
 		 616 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  45.03 
 
 		 649 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  43.73 
 
 		 616 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  41.88 
 
 		 653 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  44.89 
 
 		 622 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  42.12 
 
 		 660 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  43.67 
 
 		 618 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  46.11 
 
 		 661 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  46.11 
 
 		 661 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  43.08 
 
 		 612 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  46.11 
 
 		 646 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  46.11 
 
 		 646 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  46.11 
 
 		 646 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  46.11 
 
 		 646 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  46.11 
 
 		 646 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.94 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  43.15 
 
 		 627 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  42.15 
 
 		 614 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  42.15 
 
 		 614 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  46.23 
 
 		 667 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  43.66 
 
 		 659 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  45.02 
 
 		 610 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  44.16 
 
 		 657 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.04 
 
 		 609 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  43.14 
 
 		 627 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  42.33 
 
 		 627 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  44.27 
 
 		 636 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  44.11 
 
 		 627 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.61 
 
 		 627 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.11 
 
 		 627 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  44.43 
 
 		 627 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  39.78 
 
 		 613 aa  442  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.77 
 
 		 627 aa  442  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  40.21 
 
 		 623 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  44.18 
 
 		 638 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  39.81 
 
 		 622 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  37.5 
 
 		 621 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.65 
 
 		 924 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  40.13 
 
 		 616 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  36.71 
 
 		 624 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  28.94 
 
 		 595 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.94 
 
 		 595 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  28.78 
 
 		 595 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.01 
 
 		 600 aa  192  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  27.78 
 
 		 587 aa  175  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.67 
 
 		 566 aa  170  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  28.3 
 
 		 566 aa  170  7e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.68 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.27 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 		 561 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 		 556 aa  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.61 
 
 		 563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.62 
 
 		 548 aa  165  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>