More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4491 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  56.74 
 
 		 644 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  54.14 
 
 		 623 aa  652    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  59.81 
 
 		 645 aa  707    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  61.32 
 
 		 643 aa  724    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  62.96 
 
 		 649 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  55.49 
 
 		 660 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  66.18 
 
 		 612 aa  774    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  66.13 
 
 		 623 aa  761    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  60.37 
 
 		 637 aa  742    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  61.05 
 
 		 626 aa  752    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 		 637 aa  1275    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  56.39 
 
 		 621 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  56.74 
 
 		 654 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  60.13 
 
 		 652 aa  703    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  64.74 
 
 		 626 aa  789    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  64.13 
 
 		 649 aa  794    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  61.03 
 
 		 649 aa  757    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  63.9 
 
 		 623 aa  770    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  60.97 
 
 		 669 aa  769    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  54.55 
 
 		 624 aa  615  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  45.29 
 
 		 639 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  46.29 
 
 		 644 aa  571  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  45.66 
 
 		 644 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  45.66 
 
 		 644 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  45.81 
 
 		 644 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  45.66 
 
 		 644 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  45.66 
 
 		 644 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  46.33 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  46.33 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  50.56 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  50.08 
 
 		 607 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  49.84 
 
 		 607 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  49.68 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  51.43 
 
 		 659 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  50 
 
 		 607 aa  557  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  49.36 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  47.27 
 
 		 645 aa  554  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  47.99 
 
 		 645 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  47.07 
 
 		 645 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.72 
 
 		 609 aa  551  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  52.17 
 
 		 657 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  46.59 
 
 		 645 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  49.68 
 
 		 664 aa  544  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  50.08 
 
 		 649 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  45.92 
 
 		 646 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  46.42 
 
 		 620 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  47.38 
 
 		 612 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  49.04 
 
 		 612 aa  527  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46.9 
 
 		 643 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  47.41 
 
 		 614 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  48.23 
 
 		 622 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  43.79 
 
 		 638 aa  524  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  51.74 
 
 		 661 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  51.58 
 
 		 646 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  47.25 
 
 		 614 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  51.74 
 
 		 646 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  51.74 
 
 		 646 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  51.74 
 
 		 646 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  51.58 
 
 		 646 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  48.35 
 
 		 627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  51.58 
 
 		 661 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  45.26 
 
 		 653 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  51.18 
 
 		 667 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  45.9 
 
 		 646 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  46.96 
 
 		 643 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  47.06 
 
 		 643 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  49.13 
 
 		 627 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  45.51 
 
 		 648 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  45.51 
 
 		 648 aa  505  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.51 
 
 		 648 aa  505  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  49.61 
 
 		 627 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  46.91 
 
 		 610 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  49.13 
 
 		 627 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.45 
 
 		 627 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.13 
 
 		 627 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  46.52 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  48.5 
 
 		 636 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.86 
 
 		 627 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  47.56 
 
 		 627 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  48.9 
 
 		 638 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  41.1 
 
 		 613 aa  462  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  41.92 
 
 		 622 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  43.53 
 
 		 624 aa  429  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  43.17 
 
 		 623 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  44.59 
 
 		 616 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  41.44 
 
 		 621 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.75 
 
 		 924 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.7 
 
 		 600 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  29.6 
 
 		 595 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 595 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  29.6 
 
 		 595 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  29.8 
 
 		 587 aa  204  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.35 
 
 		 561 aa  193  7e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0813  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.62 
 
 		 569 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.73 
 
 		 584 aa  187  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  29.56 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.7 
 
 		 593 aa  187  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.84 
 
 		 563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  29.75 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.51 
 
 		 569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>