More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5695 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  53.43 
 
 		 649 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  51.83 
 
 		 637 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  56.15 
 
 		 623 aa  677    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  52.19 
 
 		 645 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  54.44 
 
 		 649 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  55.38 
 
 		 652 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  51.42 
 
 		 643 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  54.41 
 
 		 623 aa  681    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  56.39 
 
 		 637 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  58.95 
 
 		 626 aa  765    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  52.49 
 
 		 623 aa  660    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  54.63 
 
 		 669 aa  705    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  53.92 
 
 		 626 aa  666    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 		 621 aa  1290    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.6 
 
 		 649 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  53.75 
 
 		 612 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  49.84 
 
 		 624 aa  608  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  47.64 
 
 		 660 aa  589  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  47.03 
 
 		 623 aa  585  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  45.5 
 
 		 644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  45.5 
 
 		 644 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  45.64 
 
 		 644 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  46.55 
 
 		 623 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  45.79 
 
 		 644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  45.5 
 
 		 644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  45.5 
 
 		 644 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  45.38 
 
 		 639 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.6 
 
 		 654 aa  565  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  47.43 
 
 		 644 aa  562  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  44.51 
 
 		 645 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  44.71 
 
 		 645 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  45.72 
 
 		 645 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  45.73 
 
 		 643 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  46.75 
 
 		 645 aa  548  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  46.7 
 
 		 607 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  46.28 
 
 		 664 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  45.41 
 
 		 643 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  45.88 
 
 		 620 aa  532  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  45.76 
 
 		 607 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  46.23 
 
 		 616 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  42.86 
 
 		 646 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  45.18 
 
 		 616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  45.44 
 
 		 607 aa  512  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  45.28 
 
 		 607 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  44.39 
 
 		 646 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  42.5 
 
 		 638 aa  508  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  43.5 
 
 		 612 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  44.01 
 
 		 648 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  44.01 
 
 		 648 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  44.82 
 
 		 659 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.01 
 
 		 648 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  43.19 
 
 		 643 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  43.06 
 
 		 653 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  44.59 
 
 		 649 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  45.95 
 
 		 661 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  45.95 
 
 		 646 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  45.79 
 
 		 661 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  45.79 
 
 		 646 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  45.48 
 
 		 622 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  45.79 
 
 		 646 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  45.95 
 
 		 646 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  45.95 
 
 		 646 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  44.97 
 
 		 657 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  41.44 
 
 		 618 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  45.35 
 
 		 667 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.33 
 
 		 609 aa  482  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  41.59 
 
 		 627 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  42.12 
 
 		 614 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  42.93 
 
 		 612 aa  475  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  41.49 
 
 		 627 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  41.8 
 
 		 614 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  42.63 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.34 
 
 		 627 aa  465  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.93 
 
 		 627 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  41.34 
 
 		 627 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  41.17 
 
 		 613 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  41.02 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  41.18 
 
 		 627 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 627 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  41.18 
 
 		 638 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  39.84 
 
 		 627 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  40.76 
 
 		 624 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  40.87 
 
 		 623 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  40.48 
 
 		 621 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  39.74 
 
 		 622 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  41.6 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.14 
 
 		 924 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 600 aa  218  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  28.33 
 
 		 595 aa  203  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  27.67 
 
 		 595 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.67 
 
 		 595 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  29.72 
 
 		 578 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 		 581 aa  194  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.2 
 
 		 566 aa  193  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  29.96 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.25 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.12 
 
 		 557 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.41 
 
 		 561 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.03 
 
 		 581 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>