More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1621 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  51.7 
 
 
646 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  51.79 
 
 
645 aa  670    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  51.94 
 
 
644 aa  685    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  51.94 
 
 
644 aa  685    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  52.56 
 
 
644 aa  687    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1304    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  98.07 
 
 
623 aa  1283    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  51.48 
 
 
645 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  52.26 
 
 
644 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  51.16 
 
 
646 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  51.94 
 
 
644 aa  685    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  50.62 
 
 
639 aa  660    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  53.73 
 
 
645 aa  676    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  52.24 
 
 
645 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  52.1 
 
 
644 aa  687    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  50.24 
 
 
623 aa  632  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  49.14 
 
 
638 aa  628  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  49.14 
 
 
643 aa  618  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  48.64 
 
 
626 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  48.99 
 
 
643 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  48.91 
 
 
648 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.75 
 
 
648 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  48.91 
 
 
648 aa  598  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  47.03 
 
 
621 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  48.24 
 
 
623 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  48.01 
 
 
624 aa  586  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  45.91 
 
 
669 aa  582  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  46.52 
 
 
649 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  47.82 
 
 
643 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  48.64 
 
 
652 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.89 
 
 
626 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.08 
 
 
612 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  48.32 
 
 
623 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.66 
 
 
649 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  46.33 
 
 
637 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  44.3 
 
 
649 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  45.24 
 
 
645 aa  537  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  44.08 
 
 
643 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  44.97 
 
 
664 aa  530  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  45.39 
 
 
607 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  44.37 
 
 
637 aa  527  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  44.81 
 
 
607 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  44.81 
 
 
607 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  44.64 
 
 
607 aa  519  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  44.11 
 
 
653 aa  521  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  44.05 
 
 
620 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  45.98 
 
 
622 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  42.61 
 
 
660 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  43.9 
 
 
616 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  43.16 
 
 
616 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  43.27 
 
 
649 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.2 
 
 
654 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  42.41 
 
 
661 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  42.72 
 
 
612 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  42.41 
 
 
646 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  42.56 
 
 
627 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  42.25 
 
 
661 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  42.41 
 
 
646 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  42.25 
 
 
646 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  41.22 
 
 
659 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.81 
 
 
609 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  42.41 
 
 
646 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  42.41 
 
 
646 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  41.48 
 
 
657 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  41.71 
 
 
644 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  41.68 
 
 
618 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  42.43 
 
 
614 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  42.83 
 
 
627 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  42.43 
 
 
614 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.71 
 
 
627 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  40.96 
 
 
667 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  42.44 
 
 
627 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  42.18 
 
 
612 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  43.16 
 
 
636 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  43 
 
 
627 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  43.16 
 
 
627 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  40.75 
 
 
613 aa  462  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.16 
 
 
627 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  43.48 
 
 
638 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.67 
 
 
627 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  41.98 
 
 
610 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  40.82 
 
 
623 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  40.69 
 
 
622 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  38.22 
 
 
624 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  40.91 
 
 
621 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.35 
 
 
924 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  38.28 
 
 
616 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.69 
 
 
566 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  26.55 
 
 
566 aa  173  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  26.38 
 
 
577 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  25.83 
 
 
572 aa  167  6.9999999999999995e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  26.5 
 
 
555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  28.67 
 
 
587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.36 
 
 
542 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  27.26 
 
 
562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.3 
 
 
581 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  27.1 
 
 
550 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  26.17 
 
 
595 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  26.25 
 
 
595 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.25 
 
 
595 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>