More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2931 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  56.03 
 
 		 622 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  82.75 
 
 		 627 aa  1041    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  56.73 
 
 		 607 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  62.78 
 
 		 661 aa  732    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  56.73 
 
 		 607 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  62.78 
 
 		 661 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  62.78 
 
 		 646 aa  732    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  80.7 
 
 		 636 aa  991    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  53.98 
 
 		 616 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  62.3 
 
 		 667 aa  723    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  55.66 
 
 		 607 aa  667    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  63.11 
 
 		 659 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  61.27 
 
 		 649 aa  753    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  81.18 
 
 		 627 aa  987    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  69.61 
 
 		 618 aa  849    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  62.78 
 
 		 646 aa  732    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  80.54 
 
 		 627 aa  985    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  53.18 
 
 		 616 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  80.86 
 
 		 627 aa  985    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  81.18 
 
 		 627 aa  987    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  54.18 
 
 		 607 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  80.86 
 
 		 627 aa  1003    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  81.66 
 
 		 638 aa  981    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 		 627 aa  1264    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  62.78 
 
 		 646 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  62.74 
 
 		 657 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  62.78 
 
 		 646 aa  732    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  80.54 
 
 		 627 aa  1001    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  62.78 
 
 		 646 aa  732    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  52.13 
 
 		 612 aa  621  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  52.17 
 
 		 620 aa  617  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  52.24 
 
 		 614 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.97 
 
 		 609 aa  597  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  52.24 
 
 		 614 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  51.98 
 
 		 612 aa  585  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  51.03 
 
 		 610 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 626 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  47.09 
 
 		 624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  45.83 
 
 		 613 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  47.12 
 
 		 623 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  45.45 
 
 		 626 aa  511  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.74 
 
 		 612 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  43.85 
 
 		 623 aa  502  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  47.39 
 
 		 623 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  45.21 
 
 		 637 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  44.76 
 
 		 649 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  48.12 
 
 		 637 aa  492  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  42.33 
 
 		 623 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  44.87 
 
 		 622 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  43.32 
 
 		 669 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  42.44 
 
 		 623 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  45.97 
 
 		 623 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  44.72 
 
 		 645 aa  485  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  47.24 
 
 		 621 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  44.55 
 
 		 643 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  39.81 
 
 		 644 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  44.15 
 
 		 652 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  39.97 
 
 		 644 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  42.77 
 
 		 645 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  39.81 
 
 		 644 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  39.81 
 
 		 644 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  43.08 
 
 		 645 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  39.81 
 
 		 644 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  39.81 
 
 		 644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  43.42 
 
 		 645 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  42.86 
 
 		 649 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  40.45 
 
 		 645 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  40.54 
 
 		 621 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  45.09 
 
 		 648 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  45.95 
 
 		 616 aa  465  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  43.31 
 
 		 643 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.94 
 
 		 648 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  44.94 
 
 		 648 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  38.63 
 
 		 639 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  42.75 
 
 		 646 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  42.57 
 
 		 643 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  43.04 
 
 		 646 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.48 
 
 		 649 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  44.12 
 
 		 643 aa  442  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  42.11 
 
 		 644 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  39.73 
 
 		 660 aa  428  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.52 
 
 		 654 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  37.66 
 
 		 638 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.46 
 
 		 924 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  39.65 
 
 		 653 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  40.25 
 
 		 664 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  38.31 
 
 		 624 aa  351  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  30.49 
 
 		 578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  28.82 
 
 		 587 aa  181  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.62 
 
 		 612 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.5 
 
 		 581 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.94 
 
 		 566 aa  178  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8567  thiamine pyrophosphate protein central region  29.31 
 
 		 596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  29.71 
 
 		 576 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.6 
 
 		 581 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.99 
 
 		 586 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.65 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.06 
 
 		 566 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.2 
 
 		 593 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.34 
 
 		 589 aa  170  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>