More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1420 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  79.09 
 
 
621 aa  956    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  100 
 
 
623 aa  1285    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  75.12 
 
 
622 aa  954    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  54.44 
 
 
613 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  50.72 
 
 
649 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  47.27 
 
 
620 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  50.24 
 
 
659 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  47.91 
 
 
616 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  47.58 
 
 
616 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  48.73 
 
 
622 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  50.24 
 
 
657 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  48.05 
 
 
607 aa  528  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  50.32 
 
 
661 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  50.16 
 
 
667 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  50.32 
 
 
646 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  50.32 
 
 
646 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  50.32 
 
 
646 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  50.32 
 
 
646 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  50.32 
 
 
661 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  50.16 
 
 
646 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  46.79 
 
 
607 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  46.29 
 
 
627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  47.55 
 
 
627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  48.28 
 
 
607 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  48.28 
 
 
607 aa  512  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  47.52 
 
 
618 aa  511  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.79 
 
 
627 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  47.25 
 
 
636 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  47.16 
 
 
627 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  44.07 
 
 
623 aa  502  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  47.32 
 
 
627 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.16 
 
 
627 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  47.37 
 
 
638 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  47.59 
 
 
612 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.78 
 
 
609 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  46.5 
 
 
610 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  46.54 
 
 
616 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  45.81 
 
 
627 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  46.1 
 
 
614 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.79 
 
 
627 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  46.27 
 
 
614 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  43.36 
 
 
612 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  44.92 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  40.21 
 
 
645 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  39.97 
 
 
645 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  41.69 
 
 
626 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  39.78 
 
 
644 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  39.78 
 
 
644 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  40.82 
 
 
623 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  40.97 
 
 
623 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  41.26 
 
 
649 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  39.78 
 
 
644 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  39.87 
 
 
644 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  40.87 
 
 
621 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  39.62 
 
 
644 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  38.14 
 
 
644 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  40.78 
 
 
669 aa  445  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  43.02 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  42.83 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  43.17 
 
 
637 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.69 
 
 
626 aa  438  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  37.65 
 
 
639 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  39.26 
 
 
645 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  37.54 
 
 
638 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.12 
 
 
612 aa  429  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  39.4 
 
 
645 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  39.18 
 
 
646 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  40.38 
 
 
643 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.54 
 
 
643 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.83 
 
 
649 aa  425  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  40.49 
 
 
643 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  40.51 
 
 
637 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  40.18 
 
 
645 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  40.32 
 
 
652 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  38.78 
 
 
649 aa  412  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  39.43 
 
 
664 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  39.53 
 
 
643 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  39 
 
 
653 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.69 
 
 
648 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  37.8 
 
 
646 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  36.53 
 
 
648 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  36.53 
 
 
648 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  39.94 
 
 
644 aa  395  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  39.42 
 
 
660 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.47 
 
 
654 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.82 
 
 
924 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  36.82 
 
 
624 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.4 
 
 
542 aa  160  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.11 
 
 
557 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  24.19 
 
 
566 aa  152  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  25.93 
 
 
566 aa  150  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.15 
 
 
588 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  25.16 
 
 
595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.16 
 
 
595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  26.99 
 
 
578 aa  147  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.27 
 
 
566 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  25 
 
 
595 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.56 
 
 
604 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.92 
 
 
552 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.62 
 
 
555 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>