More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1335 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  61.61 
 
 		 646 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  62.79 
 
 		 645 aa  845    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  61.36 
 
 		 644 aa  844    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  61.36 
 
 		 644 aa  842    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  60.56 
 
 		 644 aa  842    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  63.26 
 
 		 645 aa  847    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  61.65 
 
 		 644 aa  847    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  61.36 
 
 		 644 aa  845    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  74.65 
 
 		 648 aa  973    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  61.36 
 
 		 644 aa  844    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  61.92 
 
 		 646 aa  781    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  74.49 
 
 		 648 aa  971    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  63.57 
 
 		 645 aa  833    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  57.59 
 
 		 639 aa  777    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  59.38 
 
 		 645 aa  783    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  100 
 
 		 643 aa  1333    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  94.56 
 
 		 643 aa  1222    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  77.76 
 
 		 643 aa  988    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  58.23 
 
 		 638 aa  759    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  74.18 
 
 		 648 aa  969    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  49.14 
 
 		 623 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  49.14 
 
 		 623 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  48.37 
 
 		 623 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  49.21 
 
 		 626 aa  599  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  45.73 
 
 		 621 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  45.82 
 
 		 624 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.75 
 
 		 626 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  47.13 
 
 		 623 aa  558  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  49.76 
 
 		 623 aa  558  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.93 
 
 		 612 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  46.96 
 
 		 607 aa  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  48 
 
 		 637 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  46.96 
 
 		 607 aa  541  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  46.79 
 
 		 649 aa  538  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  45.06 
 
 		 669 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  46.32 
 
 		 607 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  46.32 
 
 		 607 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  46.9 
 
 		 637 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  44.83 
 
 		 649 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  45.89 
 
 		 616 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  46.01 
 
 		 622 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  46.87 
 
 		 645 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  43.52 
 
 		 653 aa  521  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  45.67 
 
 		 616 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  43.8 
 
 		 620 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  46.68 
 
 		 643 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  44.51 
 
 		 659 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  47.91 
 
 		 652 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 649 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  43.49 
 
 		 612 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  43.59 
 
 		 664 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  44.36 
 
 		 657 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  44.1 
 
 		 618 aa  495  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  43.37 
 
 		 614 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  44.1 
 
 		 644 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.86 
 
 		 609 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  44.61 
 
 		 649 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  43.21 
 
 		 614 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  45.41 
 
 		 661 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  44.85 
 
 		 646 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  43.07 
 
 		 660 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  44.85 
 
 		 646 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  44.85 
 
 		 646 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  44.85 
 
 		 646 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  44.85 
 
 		 661 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  44.53 
 
 		 667 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  44.52 
 
 		 612 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  45.41 
 
 		 646 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  42.6 
 
 		 627 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  41.65 
 
 		 613 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.34 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  42.6 
 
 		 627 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 627 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  43.31 
 
 		 627 aa  465  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  43.99 
 
 		 610 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  43.08 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  43.08 
 
 		 627 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  42.44 
 
 		 638 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  42.77 
 
 		 627 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.01 
 
 		 627 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.77 
 
 		 627 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  39.6 
 
 		 622 aa  435  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  40.38 
 
 		 623 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  40.8 
 
 		 624 aa  425  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  38.74 
 
 		 621 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.64 
 
 		 924 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  41.32 
 
 		 616 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  28.07 
 
 		 595 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.07 
 
 		 595 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  27.9 
 
 		 595 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.35 
 
 		 561 aa  193  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.85 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.85 
 
 		 555 aa  190  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.68 
 
 		 570 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  28.47 
 
 		 587 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.68 
 
 		 570 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.68 
 
 		 570 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.51 
 
 		 570 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.51 
 
 		 571 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.07 
 
 		 570 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>