More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8567 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8567  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 
596 aa  1224    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  39.69 
 
 
587 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  35.62 
 
 
578 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  35.4 
 
 
576 aa  341  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.92 
 
 
600 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  35.16 
 
 
595 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.99 
 
 
595 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.99 
 
 
595 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1817  thiamine pyrophosphate protein central region  34.24 
 
 
595 aa  335  2e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.58 
 
 
566 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.23 
 
 
566 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.06 
 
 
584 aa  305  1.0000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  32.4 
 
 
566 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  32.46 
 
 
566 aa  301  2e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.53 
 
 
566 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.04 
 
 
563 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.81 
 
 
559 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.53 
 
 
566 aa  299  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.81 
 
 
582 aa  297  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.87 
 
 
554 aa  296  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.4 
 
 
574 aa  296  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.06 
 
 
563 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.69 
 
 
581 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.22 
 
 
555 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.34 
 
 
581 aa  289  9e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.4 
 
 
562 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.53 
 
 
574 aa  289  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  31.23 
 
 
574 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.18 
 
 
566 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.13 
 
 
566 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.68 
 
 
573 aa  286  9e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.34 
 
 
608 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.53 
 
 
565 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
552 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.85 
 
 
573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.38 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.11 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.16 
 
 
570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.69 
 
 
573 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  30.56 
 
 
587 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.11 
 
 
554 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.23 
 
 
557 aa  280  5e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.28 
 
 
562 aa  280  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.16 
 
 
573 aa  280  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  31.48 
 
 
599 aa  280  7e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.51 
 
 
572 aa  278  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.42 
 
 
574 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.38 
 
 
552 aa  278  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  31.34 
 
 
578 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  31.51 
 
 
562 aa  277  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.75 
 
 
563 aa  277  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  30.05 
 
 
587 aa  277  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  31.86 
 
 
573 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.94 
 
 
568 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.98 
 
 
604 aa  276  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.86 
 
 
573 aa  276  7e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  30.63 
 
 
577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.51 
 
 
561 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  31.1 
 
 
566 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.38 
 
 
555 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.93 
 
 
563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.65 
 
 
561 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.62 
 
 
615 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.49 
 
 
572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  30.05 
 
 
587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.72 
 
 
572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.45 
 
 
569 aa  274  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.99 
 
 
573 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.72 
 
 
604 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.93 
 
 
581 aa  273  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.21 
 
 
566 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.93 
 
 
581 aa  273  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.76 
 
 
595 aa  273  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  31.6 
 
 
568 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.21 
 
 
573 aa  273  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  31.47 
 
 
564 aa  273  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  30.37 
 
 
574 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  30.37 
 
 
574 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.7 
 
 
568 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  29.88 
 
 
587 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.18 
 
 
588 aa  272  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.5 
 
 
593 aa  272  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.88 
 
 
557 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  31.05 
 
 
562 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.52 
 
 
563 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.28 
 
 
572 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.28 
 
 
572 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.37 
 
 
574 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.58 
 
 
597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.38 
 
 
569 aa  271  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.37 
 
 
574 aa  271  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.14 
 
 
618 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.05 
 
 
599 aa  270  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.37 
 
 
574 aa  271  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.64 
 
 
573 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.37 
 
 
574 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.02 
 
 
574 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.33 
 
 
574 aa  269  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.78 
 
 
574 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1753  acetolactate synthase, large subunit  31.61 
 
 
590 aa  268  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00232913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>