More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2499 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  65.96 
 
 
199 aa  268  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  67.02 
 
 
213 aa  251  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.56 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  40.96 
 
 
189 aa  122  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.1 
 
 
189 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.56 
 
 
189 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.56 
 
 
198 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.11 
 
 
185 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  33.51 
 
 
387 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.98 
 
 
373 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.04 
 
 
185 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  32.81 
 
 
387 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.04 
 
 
185 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.74 
 
 
187 aa  101  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  36.57 
 
 
202 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  35.16 
 
 
198 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  35.11 
 
 
372 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  32.98 
 
 
394 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  38.75 
 
 
213 aa  99  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.99 
 
 
393 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  36.72 
 
 
189 aa  98.2  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  38.75 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.91 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.64 
 
 
399 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  32.26 
 
 
395 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  34.62 
 
 
380 aa  95.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.36 
 
 
393 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.3 
 
 
373 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.69 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  31.37 
 
 
398 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  33.68 
 
 
398 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.28 
 
 
398 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.28 
 
 
398 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.16 
 
 
372 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.16 
 
 
372 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.16 
 
 
372 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.16 
 
 
393 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.16 
 
 
393 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.16 
 
 
393 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  39.37 
 
 
393 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  33.16 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  39.1 
 
 
382 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  32.45 
 
 
384 aa  89  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.05 
 
 
370 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  38.55 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.54 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  37.5 
 
 
371 aa  82  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.29 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  27.59 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  36.02 
 
 
373 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  28.79 
 
 
378 aa  72  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  31.41 
 
 
408 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  31.41 
 
 
412 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  31.87 
 
 
721 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  36 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  34.67 
 
 
384 aa  67.8  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1536  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.98 
 
 
582 aa  65.5  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  32.82 
 
 
584 aa  64.7  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0438  acetolactate synthase large subunit  27.42 
 
 
570 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  30.37 
 
 
556 aa  62.8  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.85 
 
 
574 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05821  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.6 
 
 
587 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.449821  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.43 
 
 
548 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.43 
 
 
548 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.43 
 
 
548 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.43 
 
 
548 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.43 
 
 
548 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  30.67 
 
 
548 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.67 
 
 
548 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.67 
 
 
548 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  30.67 
 
 
548 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.11 
 
 
556 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.67 
 
 
548 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.36 
 
 
628 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.662359  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05901  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.89 
 
 
587 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5007  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.24 
 
 
621 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544612  normal  0.0507111 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.11 
 
 
618 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  26.86 
 
 
548 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.43 
 
 
548 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2038  acetolactate synthase, large subunit  28.99 
 
 
625 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206948  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2814  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  22.83 
 
 
565 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05521  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28 
 
 
587 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.98 
 
 
551 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.98 
 
 
557 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.99 
 
 
548 aa  59.3  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05291  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.89 
 
 
617 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28 
 
 
587 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  35.07 
 
 
514 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  36.11 
 
 
576 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.98 
 
 
552 aa  58.9  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30 
 
 
548 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30 
 
 
548 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.68 
 
 
582 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  35.16 
 
 
591 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0680  thiamine pyrophosphate requiring enzyme  29.53 
 
 
574 aa  58.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.98 
 
 
557 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.68 
 
 
587 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.15 
 
 
586 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  35.07 
 
 
515 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>