99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3542 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 382 aa  775    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.78 
 
 		 373 aa  346  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.61 
 
 		 370 aa  345  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  46.51 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  43.01 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  42.93 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.45 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  32.19 
 
 		 380 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  42.86 
 
 		 189 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 188 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.93 
 
 		 185 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.39 
 
 		 185 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 185 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 187 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.79 
 
 		 187 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.86 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.86 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.86 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  39.36 
 
 		 184 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.25 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.49 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.49 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  28.13 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  28.17 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.49 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  26.75 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.87 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  27.06 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  26.75 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  26.74 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  26.74 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.74 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  27.51 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  29.16 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  28.89 
 
 		 408 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  27.84 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  28.64 
 
 		 721 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  27.94 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1458  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  41.4 
 
 		 168 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  28.86 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  28.15 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1623  sulfopyruvate decarboxylase  36.88 
 
 		 192 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  26.73 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 198 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 189 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 189 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1409  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  37.87 
 
 		 166 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1227  sulfopyruvate decarboxylase  36.84 
 
 		 167 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.16 
 
 		 198 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0499  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  36.69 
 
 		 167 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.939895  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1399  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  40.8 
 
 		 166 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.293231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  31.87 
 
 		 198 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  26.42 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  33.86 
 
 		 213 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  33.85 
 
 		 199 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  39.1 
 
 		 202 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  27.3 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.97 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1187  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  36.89 
 
 		 175 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1401  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  28.75 
 
 		 168 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.07 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6412  hypothetical protein  32.52 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.519498 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6124  hypothetical protein  32.52 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1051  hypothetical protein  40.96 
 
 		 175 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2500  putative decarboxylase  27.78 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  29.08 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.88 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5426  Sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  28.47 
 
 		 166 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.69 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6791  hypothetical protein  31.03 
 
 		 180 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384747  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1238  sulfopyruvate decarboxylase  26.52 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0616406  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  28.96 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3128  putative sulfopyruvate decarboxylase (alpha subunit)  29.41 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2071  sulfopyruvate decarboxylase  27.13 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0452585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6661  putative sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  40.74 
 
 		 181 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.984154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2178  hypothetical protein  34.51 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5918  hypothetical protein  31.79 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262351  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.33 
 
 		 581 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 		 554 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  30.71 
 
 		 559 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 		 554 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.26 
 
 		 581 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.09 
 
 		 593 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  28.67 
 
 		 556 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  35.14 
 
 		 554 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1068  putative sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  28.21 
 
 		 182 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  34.23 
 
 		 556 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  28.33 
 
 		 554 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  31.2 
 
 		 572 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  30.71 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  30.71 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2843  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP bindin  25.15 
 
 		 593 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.89479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  27.46 
 
 		 637 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0277  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  24.75 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1357  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  27.45 
 
 		 265 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.79681  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0561  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  24.26 
 
 		 265 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.934592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1883  acetolactate synthase catalytic subunit  36.11 
 
 		 615 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  30.3 
 
 		 596 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  33.61 
 
 		 563 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>