197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5664 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  100 
 
 		 373 aa  756    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  47.06 
 
 		 378 aa  349  4e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  44.21 
 
 		 384 aa  301  9e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  44.24 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  44.65 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  44.92 
 
 		 721 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  43.39 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  35.62 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  33.42 
 
 		 395 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  33.93 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  33.93 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.93 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  34.27 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  35.04 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  35.44 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  34.2 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  33.67 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.32 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.76 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  33.42 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.91 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.91 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.91 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  32.74 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.54 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.54 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.54 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  29.34 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  27.84 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.12 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  28.29 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.25 
 
 		 370 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  29.06 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.87 
 
 		 187 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  41.13 
 
 		 189 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  35.57 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  36.02 
 
 		 202 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  42.57 
 
 		 189 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 185 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 185 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.43 
 
 		 188 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.6 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1187  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  31.33 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  30.56 
 
 		 199 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1409  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  31.37 
 
 		 166 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1227  sulfopyruvate decarboxylase  30.72 
 
 		 167 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  36.29 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0499  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  30.07 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.939895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.85 
 
 		 198 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1623  sulfopyruvate decarboxylase  31.61 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1458  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  31.06 
 
 		 168 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.87 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.87 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1399  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  27.95 
 
 		 166 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.293231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  30.5 
 
 		 198 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.5 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  29.69 
 
 		 555 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  25.73 
 
 		 554 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  29.69 
 
 		 552 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5426  Sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  25.71 
 
 		 166 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.23 
 
 		 568 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.81 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  28.49 
 
 		 562 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1401  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  28.82 
 
 		 168 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1068  putative sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  32.7 
 
 		 182 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  28.49 
 
 		 562 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  32.56 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  28.49 
 
 		 562 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  35.58 
 
 		 562 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.58 
 
 		 562 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  35.58 
 
 		 562 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  27.42 
 
 		 562 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  27.42 
 
 		 562 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  26.12 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  27.42 
 
 		 562 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  34.62 
 
 		 564 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2071  sulfopyruvate decarboxylase  26.72 
 
 		 166 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0452585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.26 
 
 		 561 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.41 
 
 		 562 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  29.46 
 
 		 549 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.78 
 
 		 619 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.65 
 
 		 628 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.662359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  31.16 
 
 		 562 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.78 
 
 		 619 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1238  sulfopyruvate decarboxylase  26.72 
 
 		 166 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0616406  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  27.21 
 
 		 561 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  29.13 
 
 		 548 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  27.53 
 
 		 528 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.34 
 
 		 576 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.49 
 
 		 563 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.7 
 
 		 563 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  35.76 
 
 		 582 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1121  acetolactate synthase, large subunit  40 
 
 		 563 aa  49.7  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  32.26 
 
 		 582 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>