116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1717 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  95.68 
 
 
185 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  95.14 
 
 
185 aa  363  1e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  81.62 
 
 
188 aa  316  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  63.54 
 
 
187 aa  235  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  50.27 
 
 
189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  53.05 
 
 
187 aa  164  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  45.6 
 
 
184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  41.3 
 
 
382 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  38.38 
 
 
370 aa  131  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  41.11 
 
 
373 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  38.8 
 
 
372 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.96 
 
 
373 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.8 
 
 
370 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  35.2 
 
 
380 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  33.16 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  34.95 
 
 
384 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.48 
 
 
393 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  34.52 
 
 
387 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  34.04 
 
 
199 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  33.16 
 
 
398 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  32.98 
 
 
395 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  34.04 
 
 
202 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  33.87 
 
 
393 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  38.1 
 
 
371 aa  101  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  34.34 
 
 
387 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.46 
 
 
393 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  32.62 
 
 
392 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  31.25 
 
 
394 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  32.46 
 
 
398 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.09 
 
 
372 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.09 
 
 
372 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.09 
 
 
372 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.09 
 
 
393 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.38 
 
 
399 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.61 
 
 
398 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.61 
 
 
398 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.09 
 
 
393 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.09 
 
 
393 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.16 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.07 
 
 
198 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.13 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.13 
 
 
189 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  32.14 
 
 
378 aa  88.2  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  33.16 
 
 
198 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  35.71 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  29.02 
 
 
412 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  29.02 
 
 
408 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  30.86 
 
 
373 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  29.17 
 
 
721 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.52 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.25 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  31.52 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  28.03 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  25.62 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  26.06 
 
 
384 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  29.55 
 
 
384 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  37.68 
 
 
596 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2248  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.75 
 
 
571 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0127  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.24 
 
 
593 aa  48.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  25.4 
 
 
541 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2843  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP bindin  36.07 
 
 
593 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.89479  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3746  acetolactate synthase, large subunit  31.2 
 
 
573 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.77 
 
 
572 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  25.55 
 
 
562 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  24.61 
 
 
541 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  27.21 
 
 
591 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1147  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.46 
 
 
501 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28 
 
 
569 aa  45.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  25.55 
 
 
562 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.17 
 
 
615 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  25.55 
 
 
562 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  25.55 
 
 
562 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  25.55 
 
 
562 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  25.55 
 
 
562 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  25.55 
 
 
562 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.64 
 
 
549 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.17 
 
 
499 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1448  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.56 
 
 
507 aa  44.7  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000936916  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0810  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.91 
 
 
501 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  24.82 
 
 
562 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.82 
 
 
562 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  24.82 
 
 
562 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0816  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.64 
 
 
558 aa  44.3  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1506  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  26.37 
 
 
578 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  24.48 
 
 
541 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0680  thiamine pyrophosphate requiring enzyme  34 
 
 
574 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1141  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.56 
 
 
501 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10213  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.66 
 
 
548 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.5 
 
 
573 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  24.82 
 
 
562 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  24.82 
 
 
562 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  24.82 
 
 
562 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  24.82 
 
 
562 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  24.82 
 
 
562 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0348  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  26.22 
 
 
548 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  30.4 
 
 
555 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.34 
 
 
548 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  31.34 
 
 
548 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.34 
 
 
548 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>