More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2723 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2843  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP bindin  61.82 
 
 
593 aa  722    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.89479  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 
596 aa  1187    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.72 
 
 
607 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0337  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.81 
 
 
601 aa  269  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0911018  normal  0.142003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1484  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.6 
 
 
610 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0786  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.27 
 
 
598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10450  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  31.7 
 
 
663 aa  253  6e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0127  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.21 
 
 
593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01441  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  31.78 
 
 
575 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1876  acetolactate synthase  29.13 
 
 
587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646821  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3802  acetolactate synthase large subunit  30.85 
 
 
600 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.880362  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.69 
 
 
548 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.16 
 
 
573 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0816  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.93 
 
 
558 aa  193  9e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  29.96 
 
 
566 aa  192  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.55 
 
 
564 aa  192  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.5 
 
 
548 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.79 
 
 
636 aa  192  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.32 
 
 
571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.77 
 
 
572 aa  191  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.82 
 
 
571 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4440  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.41 
 
 
600 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406956  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.38 
 
 
581 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.4 
 
 
570 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.5 
 
 
570 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.31 
 
 
567 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.45 
 
 
571 aa  188  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.4 
 
 
570 aa  188  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.4 
 
 
570 aa  188  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.4 
 
 
570 aa  188  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.68 
 
 
573 aa  187  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.55 
 
 
571 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.81 
 
 
548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.45 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.67 
 
 
587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  31.1 
 
 
605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.04 
 
 
563 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.42 
 
 
573 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.82 
 
 
572 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.86 
 
 
572 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2189  thiamine pyrophosphate protein central region  28.89 
 
 
585 aa  184  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142127  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.86 
 
 
572 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.08 
 
 
592 aa  183  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.55 
 
 
587 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.72 
 
 
572 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.86 
 
 
572 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.72 
 
 
585 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  29.3 
 
 
572 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.62 
 
 
574 aa  182  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.46 
 
 
572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.7 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.7 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.32 
 
 
572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.7 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.65 
 
 
584 aa  181  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.06 
 
 
557 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 
573 aa  180  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.25 
 
 
572 aa  180  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  30.63 
 
 
562 aa  180  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.07 
 
 
566 aa  180  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.82 
 
 
572 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.22 
 
 
612 aa  179  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  29.68 
 
 
574 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.76 
 
 
572 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.76 
 
 
572 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1959  acetolactate synthase, large subunit  28.65 
 
 
570 aa  179  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  28.3 
 
 
566 aa  179  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.55 
 
 
570 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  29.68 
 
 
574 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.76 
 
 
572 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.43 
 
 
548 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.68 
 
 
574 aa  179  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.28 
 
 
573 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.68 
 
 
574 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.68 
 
 
574 aa  179  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.91 
 
 
584 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.7 
 
 
564 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.15 
 
 
565 aa  179  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.69 
 
 
596 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1989  acetolactate synthase II, large subunit  29.44 
 
 
615 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.68 
 
 
574 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.8 
 
 
618 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.89 
 
 
572 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.19 
 
 
576 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.18 
 
 
574 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.68 
 
 
604 aa  179  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.68 
 
 
574 aa  178  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.52 
 
 
587 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.52 
 
 
587 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.24 
 
 
561 aa  178  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.87 
 
 
548 aa  178  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.76 
 
 
572 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2022  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.7 
 
 
585 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.721399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.65 
 
 
574 aa  178  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.52 
 
 
587 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.52 
 
 
587 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  28.83 
 
 
573 aa  177  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  29.46 
 
 
566 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.01 
 
 
587 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  28.52 
 
 
582 aa  177  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>