More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3802 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4440  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  88.17 
 
 
600 aa  1063    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3802  acetolactate synthase large subunit  100 
 
 
600 aa  1217    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.880362  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2189  thiamine pyrophosphate protein central region  36.73 
 
 
585 aa  353  7e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142127  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0337  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.92 
 
 
601 aa  348  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0911018  normal  0.142003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.21 
 
 
607 aa  321  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0127  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.12 
 
 
593 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0786  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.18 
 
 
598 aa  317  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10450  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  31.36 
 
 
663 aa  298  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.32 
 
 
557 aa  289  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  33.56 
 
 
566 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.17 
 
 
566 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.99 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.64 
 
 
562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.54 
 
 
563 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.3 
 
 
566 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.35 
 
 
569 aa  281  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.27 
 
 
569 aa  281  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.14 
 
 
566 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.7 
 
 
566 aa  279  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 
561 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  32.12 
 
 
567 aa  279  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.78 
 
 
566 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2671  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.16 
 
 
570 aa  278  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.343163  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.97 
 
 
636 aa  276  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.16 
 
 
569 aa  276  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  31.83 
 
 
569 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.12 
 
 
562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.16 
 
 
581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32 
 
 
569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.82 
 
 
563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.79 
 
 
559 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.19 
 
 
566 aa  273  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.7 
 
 
551 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1989  acetolactate synthase II, large subunit  34.08 
 
 
615 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.63 
 
 
581 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.12 
 
 
563 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.47 
 
 
555 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.22 
 
 
555 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  31.32 
 
 
562 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.51 
 
 
548 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.87 
 
 
557 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.68 
 
 
612 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.69 
 
 
548 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.87 
 
 
552 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.51 
 
 
548 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.87 
 
 
557 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.41 
 
 
563 aa  269  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  31.44 
 
 
562 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.51 
 
 
548 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  31.44 
 
 
562 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  31.44 
 
 
562 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.51 
 
 
548 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  31.44 
 
 
562 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.83 
 
 
548 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  31.44 
 
 
562 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.69 
 
 
548 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  30.82 
 
 
578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.48 
 
 
548 aa  267  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.87 
 
 
557 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.87 
 
 
557 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.03 
 
 
564 aa  266  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.17 
 
 
548 aa  266  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.69 
 
 
557 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4031  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.69 
 
 
557 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.57 
 
 
615 aa  264  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.98 
 
 
555 aa  264  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  30.78 
 
 
562 aa  264  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.76 
 
 
565 aa  264  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  30.78 
 
 
562 aa  264  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  30.66 
 
 
554 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.82 
 
 
562 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.5 
 
 
557 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  30.67 
 
 
562 aa  263  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  30.67 
 
 
562 aa  263  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.67 
 
 
562 aa  263  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  30.44 
 
 
566 aa  263  8e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  30.67 
 
 
562 aa  263  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  31.01 
 
 
555 aa  262  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  30.88 
 
 
577 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.16 
 
 
548 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0561  acetolactate synthase large subunit  33.5 
 
 
647 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  30.67 
 
 
562 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0654  acetolactate synthase large subunit  33.45 
 
 
647 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.8 
 
 
548 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1956  acetolactate synthase large subunit  33.33 
 
 
632 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.98 
 
 
548 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.98 
 
 
548 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.98 
 
 
548 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.48 
 
 
565 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.69 
 
 
558 aa  261  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.35 
 
 
556 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.35 
 
 
561 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  31.98 
 
 
548 aa  261  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  31.98 
 
 
548 aa  261  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  30.8 
 
 
638 aa  261  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.4 
 
 
574 aa  261  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.4 
 
 
597 aa  260  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.47 
 
 
574 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  30.78 
 
 
562 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.38 
 
 
604 aa  259  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>