More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0337 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0337  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  100 
 
 
601 aa  1251    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0911018  normal  0.142003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0786  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  53.96 
 
 
598 aa  618  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10450  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  45.1 
 
 
663 aa  543  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0127  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.15 
 
 
593 aa  536  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1484  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.81 
 
 
610 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40.1 
 
 
607 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3802  acetolactate synthase large subunit  36.92 
 
 
600 aa  339  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.880362  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2189  thiamine pyrophosphate protein central region  34.39 
 
 
585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142127  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1876  acetolactate synthase  34.01 
 
 
587 aa  324  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646821  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4440  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.15 
 
 
600 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406956  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01441  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  32.28 
 
 
575 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  31.41 
 
 
596 aa  263  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.72 
 
 
581 aa  259  9e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.72 
 
 
581 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2843  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP bindin  30.78 
 
 
593 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.89479  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  30.6 
 
 
562 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  30.6 
 
 
562 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  30.6 
 
 
562 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  30.6 
 
 
562 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  30.6 
 
 
562 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.67 
 
 
569 aa  251  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  29.54 
 
 
554 aa  246  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.53 
 
 
563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1406  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.72 
 
 
593 aa  244  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.58 
 
 
571 aa  242  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1650  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.58 
 
 
617 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121087 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.18 
 
 
569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.57 
 
 
555 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.45 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.16 
 
 
571 aa  241  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  29.86 
 
 
562 aa  240  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.15 
 
 
557 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.98 
 
 
573 aa  239  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.63 
 
 
559 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  29.36 
 
 
554 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  29.72 
 
 
562 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.34 
 
 
572 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.55 
 
 
565 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  30 
 
 
569 aa  239  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.73 
 
 
612 aa  239  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.14 
 
 
570 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  28.9 
 
 
554 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.18 
 
 
569 aa  238  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.52 
 
 
572 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.34 
 
 
572 aa  237  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  31.8 
 
 
542 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.17 
 
 
572 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  29.64 
 
 
562 aa  236  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  29.64 
 
 
562 aa  236  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.27 
 
 
574 aa  236  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.77 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  31.9 
 
 
573 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.88 
 
 
570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.41 
 
 
572 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.32 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.76 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.7 
 
 
570 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.7 
 
 
570 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1989  acetolactate synthase II, large subunit  32.76 
 
 
615 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.7 
 
 
570 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  29.53 
 
 
555 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  29.54 
 
 
562 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  29.53 
 
 
555 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 
571 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.77 
 
 
557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.45 
 
 
602 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  29.29 
 
 
562 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.29 
 
 
562 aa  233  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  29.29 
 
 
562 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  29.18 
 
 
562 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  29.46 
 
 
562 aa  233  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.24 
 
 
572 aa  233  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.62 
 
 
571 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.24 
 
 
572 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.82 
 
 
566 aa  233  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.21 
 
 
573 aa  233  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.24 
 
 
572 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.42 
 
 
573 aa  232  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.52 
 
 
576 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.13 
 
 
587 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.31 
 
 
572 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.3 
 
 
573 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  28.73 
 
 
554 aa  231  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.25 
 
 
565 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.91 
 
 
572 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  29.08 
 
 
566 aa  231  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.05 
 
 
566 aa  231  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.04 
 
 
564 aa  231  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.3 
 
 
636 aa  230  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  30.77 
 
 
574 aa  230  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  31.8 
 
 
567 aa  229  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.09 
 
 
558 aa  230  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.1 
 
 
579 aa  229  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.86 
 
 
570 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  29.54 
 
 
564 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.48 
 
 
618 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 
619 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  28.82 
 
 
564 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  30.24 
 
 
623 aa  229  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.4 
 
 
552 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>