More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10450 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10450  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  100 
 
 
663 aa  1376    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0337  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  45.1 
 
 
601 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0911018  normal  0.142003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0786  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  46.81 
 
 
598 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0127  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.16 
 
 
593 aa  416  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1484  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.33 
 
 
610 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.2 
 
 
607 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2189  thiamine pyrophosphate protein central region  34.66 
 
 
585 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142127  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3802  acetolactate synthase large subunit  31.36 
 
 
600 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.880362  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4440  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.67 
 
 
600 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1876  acetolactate synthase  31.26 
 
 
587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646821  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.61 
 
 
569 aa  265  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.09 
 
 
569 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  31.09 
 
 
569 aa  259  9e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.07 
 
 
566 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.69 
 
 
542 aa  251  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.63 
 
 
557 aa  249  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.48 
 
 
581 aa  249  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  31.93 
 
 
596 aa  248  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  30.41 
 
 
567 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.41 
 
 
573 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.86 
 
 
566 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.83 
 
 
552 aa  244  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.88 
 
 
573 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.99 
 
 
581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.15 
 
 
573 aa  244  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  29.2 
 
 
577 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  31.18 
 
 
573 aa  243  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  28.67 
 
 
578 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  29.53 
 
 
566 aa  240  6.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.53 
 
 
566 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.54 
 
 
570 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.69 
 
 
566 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.04 
 
 
601 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.97 
 
 
566 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.72 
 
 
553 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.78 
 
 
565 aa  236  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.52 
 
 
569 aa  236  8e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.05 
 
 
589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.56 
 
 
565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.3 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.9 
 
 
561 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.56 
 
 
557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.08 
 
 
555 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  30.28 
 
 
623 aa  233  6e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.39 
 
 
569 aa  232  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.56 
 
 
598 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.63 
 
 
573 aa  233  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.6 
 
 
535 aa  232  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  28.72 
 
 
566 aa  232  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.08 
 
 
636 aa  232  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  28.65 
 
 
554 aa  232  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.14 
 
 
573 aa  231  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.8 
 
 
566 aa  230  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.43 
 
 
581 aa  230  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  28.25 
 
 
562 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  28.25 
 
 
562 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.14 
 
 
581 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.97 
 
 
571 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.14 
 
 
581 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  28.25 
 
 
562 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  28.25 
 
 
562 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  28.25 
 
 
562 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.54 
 
 
570 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.09 
 
 
570 aa  228  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.99 
 
 
563 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  27.63 
 
 
554 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  29.54 
 
 
564 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.51 
 
 
565 aa  228  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.92 
 
 
570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.92 
 
 
570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.92 
 
 
570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  29.31 
 
 
605 aa  227  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.86 
 
 
586 aa  227  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  27.44 
 
 
554 aa  227  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.86 
 
 
588 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  29.88 
 
 
569 aa  226  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3640  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.74 
 
 
608 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.32 
 
 
564 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  30.71 
 
 
566 aa  226  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.17 
 
 
581 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.99 
 
 
571 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  29.72 
 
 
568 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.36 
 
 
627 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.69 
 
 
563 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.74 
 
 
556 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.5 
 
 
570 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.71 
 
 
554 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.36 
 
 
581 aa  224  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.77 
 
 
563 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.56 
 
 
568 aa  224  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.71 
 
 
611 aa  223  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.24 
 
 
556 aa  223  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1319  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.97 
 
 
570 aa  223  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.57 
 
 
561 aa  223  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.17 
 
 
558 aa  223  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.56 
 
 
568 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1311  acetolactate synthase catalytic subunit  30.09 
 
 
574 aa  223  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.09 
 
 
629 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.28 
 
 
555 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.2 
 
 
571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>