174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1052 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  100 
 
 
196 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.27 
 
 
198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50 
 
 
189 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.47 
 
 
189 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46.49 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  44.68 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  50.26 
 
 
193 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.36 
 
 
187 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  39.74 
 
 
189 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.81 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  34.52 
 
 
213 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  36.71 
 
 
189 aa  88.6  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.57 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  30.72 
 
 
378 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.12 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.71 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  32.97 
 
 
382 aa  85.1  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.68 
 
 
185 aa  85.1  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.51 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  31.29 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.33 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  34.85 
 
 
392 aa  79  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.47 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.76 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  34.16 
 
 
380 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  34.15 
 
 
384 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.33 
 
 
372 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  36.51 
 
 
370 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  36.43 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  32.16 
 
 
395 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.66 
 
 
393 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  33.13 
 
 
387 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  35.66 
 
 
387 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  35.66 
 
 
393 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.88 
 
 
399 aa  71.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.11 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  35.66 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.53 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.88 
 
 
393 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.11 
 
 
398 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.11 
 
 
398 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 
398 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.64 
 
 
373 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  33.54 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  32.92 
 
 
412 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  35.04 
 
 
721 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  34.38 
 
 
371 aa  62  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  31.5 
 
 
373 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  34.81 
 
 
384 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  32.03 
 
 
513 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.26 
 
 
581 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  36.71 
 
 
384 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  23.12 
 
 
554 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  24.87 
 
 
555 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.72 
 
 
581 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  24.87 
 
 
555 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  29.46 
 
 
556 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1240  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.42 
 
 
580 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  40.85 
 
 
583 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2814  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.37 
 
 
565 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  23.23 
 
 
554 aa  48.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  29.51 
 
 
554 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1883  acetolactate synthase catalytic subunit  28.24 
 
 
615 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  26.32 
 
 
564 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  25.45 
 
 
562 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  23 
 
 
562 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  25.45 
 
 
562 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  23 
 
 
562 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  25.45 
 
 
562 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 
554 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1631  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.91 
 
 
559 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  25.45 
 
 
562 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  23 
 
 
562 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  23 
 
 
562 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 
562 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  25.45 
 
 
562 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  23 
 
 
562 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  24.85 
 
 
562 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.85 
 
 
562 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  24.85 
 
 
562 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  29.06 
 
 
555 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  24.85 
 
 
562 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  38.71 
 
 
623 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1899  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  37.96 
 
 
570 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  36.84 
 
 
564 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.18 
 
 
549 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1948  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.81 
 
 
261 aa  45.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0727116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3125  acetolactate synthase, large subunit  30.34 
 
 
564 aa  45.1  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  27.97 
 
 
542 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  38.81 
 
 
555 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.47 
 
 
562 aa  44.7  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0143  hypothetical protein  34.29 
 
 
546 aa  44.7  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.95 
 
 
581 aa  44.7  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>