174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6662 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  62.43 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  58.42 
 
 
198 aa  227  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  53.97 
 
 
198 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.22 
 
 
189 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  51.67 
 
 
189 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  50.26 
 
 
196 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  38.51 
 
 
189 aa  105  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  38.55 
 
 
202 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  45.76 
 
 
213 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.21 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.44 
 
 
372 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.5 
 
 
187 aa  92  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.52 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  32.39 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  39.39 
 
 
371 aa  87.8  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.51 
 
 
373 aa  87.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.91 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.03 
 
 
373 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.7 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.07 
 
 
188 aa  85.1  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  28.96 
 
 
382 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.32 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.29 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.21 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  34.1 
 
 
387 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  32.75 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  33.53 
 
 
387 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  32.2 
 
 
384 aa  71.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.48 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.14 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  33.14 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  32.2 
 
 
398 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  36.11 
 
 
394 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  35.37 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  32.76 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  26.79 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.49 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.49 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.9 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.9 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.9 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  34.35 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.9 
 
 
372 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.9 
 
 
372 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.9 
 
 
372 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  38.95 
 
 
393 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  36.84 
 
 
399 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  32.31 
 
 
721 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.56 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.33 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  32.31 
 
 
412 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  32.31 
 
 
408 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  32.19 
 
 
384 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  33.33 
 
 
384 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  32.09 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.77 
 
 
574 aa  48.9  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  39.19 
 
 
556 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0283  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34.51 
 
 
361 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1235  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34.29 
 
 
270 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  31.43 
 
 
582 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  30.71 
 
 
582 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1420  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34.29 
 
 
276 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464193  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  40.85 
 
 
624 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0660  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  32.74 
 
 
348 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4010  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34.29 
 
 
276 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  38.46 
 
 
623 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3719  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.15 
 
 
333 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  29.85 
 
 
373 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  33.33 
 
 
627 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0313  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  32.74 
 
 
353 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  32.61 
 
 
591 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3951  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.19 
 
 
574 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3566  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34 
 
 
368 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3639  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34 
 
 
368 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260577  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2028  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
591 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103551  normal  0.0583023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3571  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34 
 
 
368 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0203  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  33.33 
 
 
277 aa  45.1  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.258003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4392  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  32.74 
 
 
357 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  33.62 
 
 
575 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0071  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  33.33 
 
 
354 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  28.97 
 
 
554 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.77 
 
 
627 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  32.77 
 
 
627 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  33.33 
 
 
645 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  28.78 
 
 
554 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  34.72 
 
 
645 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  29.81 
 
 
621 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  31.3 
 
 
636 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  42.86 
 
 
582 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  31.93 
 
 
638 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0554  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  33.63 
 
 
353 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.93 
 
 
627 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  39.44 
 
 
623 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.93 
 
 
627 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  30.07 
 
 
627 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7672  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.74 
 
 
339 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  28.97 
 
 
555 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  31.93 
 
 
627 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  28.97 
 
 
555 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>