105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1909 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  95.16 
 
 
372 aa  688    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  95.67 
 
 
393 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  83.08 
 
 
393 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  100 
 
 
393 aa  785    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  83.33 
 
 
398 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  83.21 
 
 
393 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  83.33 
 
 
398 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  95.16 
 
 
372 aa  688    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  95.16 
 
 
372 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  95.67 
 
 
393 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  95.67 
 
 
393 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  85.13 
 
 
395 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  83.33 
 
 
398 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  82.95 
 
 
398 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  79.9 
 
 
387 aa  628  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  79.9 
 
 
387 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  78.01 
 
 
394 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  76.14 
 
 
399 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  56.89 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  46.88 
 
 
380 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  46.75 
 
 
392 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.3 
 
 
370 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  34.92 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  33.67 
 
 
373 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  37.18 
 
 
408 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  36.67 
 
 
721 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  34.86 
 
 
412 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  30.3 
 
 
384 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  33.73 
 
 
384 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  28.13 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  27.06 
 
 
373 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  28.31 
 
 
371 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  28.68 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.09 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.8 
 
 
370 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  33.5 
 
 
199 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.68 
 
 
185 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  34.54 
 
 
213 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.46 
 
 
185 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.16 
 
 
185 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.89 
 
 
187 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  42.73 
 
 
189 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.16 
 
 
188 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  33.85 
 
 
202 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.59 
 
 
187 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1458  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  35.67 
 
 
168 aa  90.1  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.33 
 
 
189 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.61 
 
 
184 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1227  sulfopyruvate decarboxylase  34.17 
 
 
167 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1409  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  34.17 
 
 
166 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0499  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  34.17 
 
 
167 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.939895  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.85 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1399  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  32.76 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.293231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  34.2 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1187  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  32.26 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1623  sulfopyruvate decarboxylase  32.8 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1401  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  30.43 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.88 
 
 
196 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.07 
 
 
189 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.07 
 
 
189 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  31.66 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  32.89 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.73 
 
 
223 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  36.67 
 
 
213 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6661  putative sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  39.05 
 
 
181 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.984154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1068  putative sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  29.33 
 
 
182 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3128  putative sulfopyruvate decarboxylase (alpha subunit)  30.22 
 
 
182 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2500  putative decarboxylase  27.27 
 
 
177 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1051  hypothetical protein  35.16 
 
 
175 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2071  sulfopyruvate decarboxylase  29.41 
 
 
166 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0452585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6791  hypothetical protein  36.67 
 
 
180 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384747  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6412  hypothetical protein  40.28 
 
 
178 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.519498 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6124  hypothetical protein  40.28 
 
 
178 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2178  hypothetical protein  36.67 
 
 
179 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1238  sulfopyruvate decarboxylase  28.71 
 
 
166 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0616406  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5426  Sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  27.72 
 
 
166 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  33.33 
 
 
193 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5918  hypothetical protein  36.67 
 
 
178 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262351  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4490  acetolactate synthase, large subunit  30.88 
 
 
621 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5007  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.51 
 
 
621 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544612  normal  0.0507111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  30.77 
 
 
554 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  23.83 
 
 
545 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  32.43 
 
 
551 aa  47  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.69 
 
 
600 aa  47  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0696  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.81 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0217424  normal  0.137282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2814  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.59 
 
 
565 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  31.4 
 
 
562 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1530  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.88 
 
 
537 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.717927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2038  acetolactate synthase, large subunit  35.63 
 
 
625 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206948  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  41.38 
 
 
561 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  40 
 
 
562 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2028  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.83 
 
 
591 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103551  normal  0.0583023 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2119  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.61 
 
 
621 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0348  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.07 
 
 
548 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.49 
 
 
529 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  31.93 
 
 
555 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  31.93 
 
 
555 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  42.37 
 
 
567 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  38.98 
 
 
570 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  39.13 
 
 
556 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>