More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1930 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
529 aa  1075    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  53.89 
 
 
591 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  54.27 
 
 
589 aa  568  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  40.11 
 
 
566 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  40.11 
 
 
566 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  39.73 
 
 
566 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  39.35 
 
 
566 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  39.54 
 
 
566 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.98 
 
 
649 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  40 
 
 
656 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  36.33 
 
 
578 aa  330  4e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  33.33 
 
 
579 aa  323  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  33.4 
 
 
579 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  33.4 
 
 
579 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.84 
 
 
549 aa  319  9e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  35.88 
 
 
584 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  35.23 
 
 
576 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  34.01 
 
 
599 aa  287  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08220  pyruvate oxidase  31.31 
 
 
534 aa  286  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2732  thiamine pyrophosphate protein  34.55 
 
 
596 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109736  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  33.82 
 
 
588 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  33.87 
 
 
587 aa  282  9e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.08 
 
 
553 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  32.91 
 
 
584 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  35.26 
 
 
590 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  34.9 
 
 
590 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.39 
 
 
557 aa  277  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.7 
 
 
557 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0808  thiamine pyrophosphate protein  33.58 
 
 
593 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6220  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.21 
 
 
596 aa  277  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863586  normal  0.0472829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.09 
 
 
555 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  32.68 
 
 
587 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.89 
 
 
574 aa  272  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.06 
 
 
552 aa  272  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  32.5 
 
 
587 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.58 
 
 
555 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  34.56 
 
 
555 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.95 
 
 
563 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.33 
 
 
563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  32.85 
 
 
587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.15 
 
 
569 aa  270  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  34.61 
 
 
601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.7 
 
 
581 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.7 
 
 
581 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  31.71 
 
 
563 aa  270  7e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  33.09 
 
 
552 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  32.86 
 
 
599 aa  269  8e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0856  thiamine pyrophosphate protein  33.33 
 
 
593 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.701267  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4042  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.98 
 
 
605 aa  269  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.7 
 
 
562 aa  269  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0784  thiamine pyrophosphate protein  33.45 
 
 
608 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.77 
 
 
588 aa  267  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.42 
 
 
576 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0772  thiamine pyrophosphate protein  33.64 
 
 
608 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0548988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  32.78 
 
 
603 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0946  thiamine pyrophosphate protein  33.45 
 
 
744 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217897  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.03 
 
 
552 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  34.26 
 
 
578 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2436  thiamine pyrophosphate protein  32.42 
 
 
595 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262777  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2979  thiamine pyrophosphate protein  32.6 
 
 
595 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0396438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.45 
 
 
601 aa  264  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.03 
 
 
596 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.686266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0414  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.12 
 
 
597 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.15 
 
 
561 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0068  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.21 
 
 
596 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.736165  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0860  thiamine pyrophosphate protein  32.79 
 
 
593 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2966  thiamine pyrophosphate protein  32.97 
 
 
595 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.482904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08480  thiamine pyrophosphate protein  33.76 
 
 
598 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00807055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2089  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.79 
 
 
597 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2355  thiamine pyrophosphate protein  32.36 
 
 
598 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320889  hitchhiker  0.000848806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.9 
 
 
563 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.43 
 
 
582 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.24 
 
 
566 aa  259  8e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.09 
 
 
554 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.67 
 
 
561 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.91 
 
 
566 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  34.08 
 
 
577 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.46 
 
 
563 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.41 
 
 
564 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.09 
 
 
564 aa  258  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  32.58 
 
 
576 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.2 
 
 
535 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.33 
 
 
570 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.15 
 
 
571 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  33.64 
 
 
551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5492  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.12 
 
 
597 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.56 
 
 
559 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.03 
 
 
576 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  32.42 
 
 
569 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  33.76 
 
 
618 aa  254  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.7 
 
 
556 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3376  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.5 
 
 
586 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  31.99 
 
 
542 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  32.46 
 
 
576 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.11 
 
 
554 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.18 
 
 
581 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.15 
 
 
588 aa  253  9.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7490  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.37 
 
 
591 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300695  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  33.15 
 
 
562 aa  252  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  34.37 
 
 
620 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>