More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4353 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1012    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  73.83 
 
 		 512 aa  706    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  52.87 
 
 		 517 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  50.97 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  50.77 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  51.17 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  51.16 
 
 		 518 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  50.58 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  48.56 
 
 		 553 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  50.87 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  50.39 
 
 		 518 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  48.76 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  47.29 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  50.29 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  50.19 
 
 		 519 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  50.19 
 
 		 516 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  50 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  48.44 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  48.37 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  48.46 
 
 		 514 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  47.78 
 
 		 551 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  49.81 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  49.43 
 
 		 531 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  49.22 
 
 		 514 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  48.26 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  49.32 
 
 		 515 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  49.71 
 
 		 519 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  49.32 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  47.37 
 
 		 519 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  49.71 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  46.41 
 
 		 531 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  45.79 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  47 
 
 		 527 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  45.37 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  46.05 
 
 		 529 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  46.8 
 
 		 526 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  44.08 
 
 		 513 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  43.35 
 
 		 508 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  36.79 
 
 		 506 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  27.24 
 
 		 589 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28.21 
 
 		 545 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.14 
 
 		 542 aa  151  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  23.65 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  29.38 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  27.86 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  28.15 
 
 		 529 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.73 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  26.69 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  25.96 
 
 		 568 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  34.29 
 
 		 652 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  27.98 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  31.02 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  27.79 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  28.84 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  27.29 
 
 		 536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  26.72 
 
 		 518 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  27.77 
 
 		 535 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  27.82 
 
 		 548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.22 
 
 		 566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  26.08 
 
 		 529 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  27.92 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 551 aa  124  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  30.62 
 
 		 564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  25.32 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  27.43 
 
 		 540 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  25.95 
 
 		 570 aa  119  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  27.51 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  26.34 
 
 		 552 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  27.5 
 
 		 539 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.22 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.33 
 
 		 536 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.12 
 
 		 561 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.4 
 
 		 499 aa  113  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  26.32 
 
 		 547 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28.14 
 
 		 543 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.02 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  25.05 
 
 		 563 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  25.77 
 
 		 547 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  25.77 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  25.59 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  25.59 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  25.59 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  26.37 
 
 		 540 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  25.09 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  27.72 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  25.59 
 
 		 547 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  25.59 
 
 		 547 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  24.64 
 
 		 548 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  27.47 
 
 		 539 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  24.73 
 
 		 547 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  24.46 
 
 		 547 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  27.47 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  27.47 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  27.47 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  27.47 
 
 		 539 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  27.47 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  25.59 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.71 
 
 		 658 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  27.47 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>