More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2852 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1019    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  77.86 
 
 		 537 aa  766    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  90.68 
 
 		 515 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  56.31 
 
 		 514 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  56.14 
 
 		 513 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  58.53 
 
 		 515 aa  531  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  56.43 
 
 		 531 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  59.03 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  56.59 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  58.17 
 
 		 514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  58.17 
 
 		 512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  57.81 
 
 		 514 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  57.48 
 
 		 514 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  58.3 
 
 		 515 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  56.78 
 
 		 516 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  52.33 
 
 		 552 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  51.73 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  54.97 
 
 		 519 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  53.31 
 
 		 518 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  53.4 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  53.02 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  52.42 
 
 		 551 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  50.68 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  53.61 
 
 		 519 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  51.64 
 
 		 529 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  50.68 
 
 		 527 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  50.49 
 
 		 529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  52.22 
 
 		 555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  53.02 
 
 		 508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  52.33 
 
 		 518 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  51.95 
 
 		 513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  52.08 
 
 		 531 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  52.32 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  50.39 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  50.8 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  53.37 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  49.32 
 
 		 513 aa  412  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  51.07 
 
 		 526 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  35.7 
 
 		 506 aa  205  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.73 
 
 		 568 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  39.31 
 
 		 652 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.95 
 
 		 542 aa  159  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  29.96 
 
 		 529 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  30.48 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  29.96 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.94 
 
 		 540 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.49 
 
 		 545 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  27.33 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  29.12 
 
 		 525 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  27.78 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  26.49 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  27.89 
 
 		 535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.79 
 
 		 658 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  27.7 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  28.24 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.05 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.4 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  26.84 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.35 
 
 		 551 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  26 
 
 		 540 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  25.42 
 
 		 537 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  23.62 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  23.62 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  24.23 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  23.62 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  23.99 
 
 		 546 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  23.8 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  24.28 
 
 		 546 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  23.03 
 
 		 550 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  25.59 
 
 		 547 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  27.44 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  23.85 
 
 		 548 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  22.67 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  33.92 
 
 		 527 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  28.79 
 
 		 558 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  23.62 
 
 		 546 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  23.99 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  22.85 
 
 		 550 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  23.8 
 
 		 546 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  23.8 
 
 		 546 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  23.8 
 
 		 546 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  23.8 
 
 		 546 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  23.8 
 
 		 546 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  25.32 
 
 		 556 aa  100  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  23.8 
 
 		 546 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  23.8 
 
 		 546 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  26.09 
 
 		 567 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  22.71 
 
 		 550 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  22.37 
 
 		 545 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.31 
 
 		 593 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  34.15 
 
 		 529 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  27.14 
 
 		 538 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  23.61 
 
 		 547 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  32.57 
 
 		 554 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.26 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  26.31 
 
 		 548 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  24.22 
 
 		 547 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  24.22 
 
 		 547 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>