More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3003 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  73.83 
 
 		 513 aa  682    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1011    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  51.36 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  51.94 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  51.34 
 
 		 518 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  50.87 
 
 		 518 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  51.83 
 
 		 517 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  52.23 
 
 		 519 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  50.1 
 
 		 518 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  51.07 
 
 		 551 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  51.84 
 
 		 555 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  49.03 
 
 		 552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  49.81 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  51.65 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  48.74 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  49.42 
 
 		 516 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  48.84 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  50.58 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  50.29 
 
 		 515 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  49.13 
 
 		 537 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  51.51 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  48.44 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  48.56 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  49.61 
 
 		 531 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  48.45 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  48.73 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  49.12 
 
 		 519 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  47.86 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  49.8 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  49.03 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  50.19 
 
 		 519 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  46.9 
 
 		 529 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  49.81 
 
 		 515 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  46.81 
 
 		 527 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  46.15 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  47.3 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  46.48 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  43.16 
 
 		 513 aa  345  8.999999999999999e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  36.42 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.83 
 
 		 545 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  25.8 
 
 		 589 aa  180  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.8 
 
 		 568 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.07 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  37.9 
 
 		 652 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  27.48 
 
 		 552 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.49 
 
 		 542 aa  150  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  28.76 
 
 		 525 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  29.02 
 
 		 528 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  30.25 
 
 		 540 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  27.99 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.61 
 
 		 536 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  30.9 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  28.2 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.36 
 
 		 543 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  25.56 
 
 		 529 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  27.51 
 
 		 518 aa  133  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.65 
 
 		 568 aa  133  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.99 
 
 		 658 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  27.11 
 
 		 547 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  26.92 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  27.08 
 
 		 528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.53 
 
 		 561 aa  127  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.37 
 
 		 533 aa  126  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  27.44 
 
 		 552 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  26.89 
 
 		 549 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.32 
 
 		 540 aa  123  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.73 
 
 		 596 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  27.73 
 
 		 570 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  26.61 
 
 		 552 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  25.76 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  27.49 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  25.64 
 
 		 547 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  25.64 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  25.64 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  25.64 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  25.64 
 
 		 547 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  25.64 
 
 		 547 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  28.06 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  28.07 
 
 		 536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  25.82 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  26.57 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  23.86 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  26.01 
 
 		 562 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  26.85 
 
 		 548 aa  115  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  27.85 
 
 		 529 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28.12 
 
 		 542 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  28.6 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.09 
 
 		 574 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  26.7 
 
 		 562 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  26.7 
 
 		 562 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  26.2 
 
 		 562 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  26.7 
 
 		 562 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  25.41 
 
 		 547 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  26.2 
 
 		 565 aa  114  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  26.2 
 
 		 562 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.99 
 
 		 566 aa  113  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  25.93 
 
 		 549 aa  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  27.66 
 
 		 535 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  26.06 
 
 		 565 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>