More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4594 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1026    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  57.81 
 
 		 515 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  55.6 
 
 		 513 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  53.4 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  56.05 
 
 		 537 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  55.47 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  55.9 
 
 		 531 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  54.32 
 
 		 529 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  54.74 
 
 		 527 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  55.08 
 
 		 515 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  51.74 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  54.65 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  54.26 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  56.76 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  54.55 
 
 		 515 aa  485  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  54.46 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  55.51 
 
 		 515 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  52.33 
 
 		 512 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  54.47 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  51.16 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  48.35 
 
 		 552 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  49.33 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  50.19 
 
 		 518 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  51.07 
 
 		 513 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  50.68 
 
 		 518 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  50.68 
 
 		 516 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  48.65 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  51.45 
 
 		 519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  49.81 
 
 		 551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  51.14 
 
 		 531 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  49.61 
 
 		 519 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  49.33 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  51.36 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  50 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  52.22 
 
 		 519 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  52.25 
 
 		 508 aa  425  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  47.69 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  45.45 
 
 		 526 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  34.85 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.78 
 
 		 542 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28.62 
 
 		 545 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  29.68 
 
 		 527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  28.76 
 
 		 529 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  29.04 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  29 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  29.17 
 
 		 528 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.88 
 
 		 540 aa  149  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  25.68 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  29.62 
 
 		 528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  29.62 
 
 		 549 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  43.48 
 
 		 652 aa  145  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  28.44 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.6 
 
 		 536 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  26.59 
 
 		 525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  29.74 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  27.32 
 
 		 540 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  28.17 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  27.34 
 
 		 537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  27.03 
 
 		 540 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  27.65 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  27.46 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  26.47 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.72 
 
 		 542 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  25.84 
 
 		 572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  27.69 
 
 		 529 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.01 
 
 		 568 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  26.69 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.62 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  25.82 
 
 		 539 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.1 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  29.44 
 
 		 589 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  25.99 
 
 		 540 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  28.73 
 
 		 543 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.15 
 
 		 566 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.74 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  26.36 
 
 		 541 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.56 
 
 		 581 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.99 
 
 		 658 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  27.05 
 
 		 541 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  25.41 
 
 		 553 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  27.27 
 
 		 541 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  24.29 
 
 		 567 aa  97.8  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  22.59 
 
 		 550 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  23.19 
 
 		 542 aa  94.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  24.26 
 
 		 563 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.14 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.84 
 
 		 593 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  21.53 
 
 		 550 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  23.24 
 
 		 550 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  23.24 
 
 		 550 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  21.9 
 
 		 550 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  22.1 
 
 		 545 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  24.27 
 
 		 547 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>