More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0107 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  67.05 
 
 		 519 aa  649    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  100 
 
 		 519 aa  1028    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  64.81 
 
 		 515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  62.76 
 
 		 531 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  61.08 
 
 		 516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  64.94 
 
 		 519 aa  568  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  58.96 
 
 		 552 aa  571  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  59.92 
 
 		 551 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  59.66 
 
 		 555 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  57.72 
 
 		 553 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  55.81 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  55.81 
 
 		 518 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  54.16 
 
 		 514 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  54.65 
 
 		 518 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  54.07 
 
 		 518 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  54.97 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  54.65 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  52.62 
 
 		 537 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  52.91 
 
 		 513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  53.58 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  51.56 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  54.93 
 
 		 515 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  52.62 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  51.92 
 
 		 515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  51.82 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  51.07 
 
 		 512 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  50.78 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  50.29 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  50.97 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  50.78 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  50 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  49.32 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  46.44 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  47.02 
 
 		 529 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  47.98 
 
 		 529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  50.59 
 
 		 508 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  48.94 
 
 		 513 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  49.22 
 
 		 526 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  37.8 
 
 		 506 aa  217  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.92 
 
 		 568 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  38.68 
 
 		 652 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  27.21 
 
 		 589 aa  173  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.37 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.37 
 
 		 562 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.38 
 
 		 542 aa  150  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  30.3 
 
 		 528 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.96 
 
 		 545 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  28.49 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  27.86 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  28.03 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.6 
 
 		 551 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  28.39 
 
 		 529 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  29.09 
 
 		 540 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  27.12 
 
 		 529 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.48 
 
 		 542 aa  133  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 536 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.88 
 
 		 540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  28.47 
 
 		 539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  28.81 
 
 		 528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  29.76 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  29 
 
 		 549 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  27.59 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.38 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  28.52 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.26 
 
 		 596 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  27.57 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.04 
 
 		 658 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  28.19 
 
 		 535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  27.65 
 
 		 548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  28.01 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  27.94 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  26.54 
 
 		 518 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  35.36 
 
 		 554 aa  113  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  24.91 
 
 		 567 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 533 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  25.62 
 
 		 552 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  27.82 
 
 		 539 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  28.01 
 
 		 539 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  28.01 
 
 		 539 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.77 
 
 		 557 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  23.43 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  25.67 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  25.71 
 
 		 533 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  24.36 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  23.81 
 
 		 548 aa  104  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  24.64 
 
 		 551 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  24.6 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  27.06 
 
 		 555 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  25.31 
 
 		 554 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  24.09 
 
 		 556 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.74 
 
 		 562 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.84 
 
 		 570 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  25.95 
 
 		 572 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  23.31 
 
 		 562 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  23.33 
 
 		 547 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  23.33 
 
 		 547 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  23.58 
 
 		 542 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1536  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.38 
 
 		 582 aa  99.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>