More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2527 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  79.68 
 
 
562 aa  853    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  91.81 
 
 
562 aa  1018    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
562 aa  1118    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  99.82 
 
 
562 aa  1116    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  38.98 
 
 
545 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  36.89 
 
 
554 aa  350  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.45 
 
 
559 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  35.39 
 
 
537 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.68 
 
 
551 aa  258  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  33.58 
 
 
529 aa  256  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.01 
 
 
536 aa  256  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.27 
 
 
540 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  35.15 
 
 
540 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.04 
 
 
568 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.87 
 
 
561 aa  251  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  34.62 
 
 
542 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  34 
 
 
540 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.42 
 
 
542 aa  248  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.09 
 
 
658 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  34.48 
 
 
548 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  33.15 
 
 
529 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  35.33 
 
 
536 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  33.82 
 
 
528 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  34.92 
 
 
539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.33 
 
 
565 aa  240  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  35.03 
 
 
535 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  35.43 
 
 
535 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  33.04 
 
 
529 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  35.25 
 
 
535 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  35.26 
 
 
535 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  34.61 
 
 
533 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.1 
 
 
542 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  34.3 
 
 
535 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.01 
 
 
499 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  34.64 
 
 
539 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  34.64 
 
 
539 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  34.39 
 
 
539 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.87 
 
 
533 aa  225  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  34.39 
 
 
539 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  34.39 
 
 
539 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  34.39 
 
 
539 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  34.39 
 
 
539 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  33.59 
 
 
540 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  32.61 
 
 
518 aa  223  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  34.03 
 
 
572 aa  223  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  32.16 
 
 
535 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  27.71 
 
 
589 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  31.31 
 
 
549 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  31.88 
 
 
540 aa  210  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  30.82 
 
 
528 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  32.6 
 
 
525 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  29.33 
 
 
528 aa  204  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  42.54 
 
 
527 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.82 
 
 
503 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.45 
 
 
566 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  28.83 
 
 
551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.4 
 
 
566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1108  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.97 
 
 
489 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0811747  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.65 
 
 
563 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.01 
 
 
556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.01 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  26.93 
 
 
552 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  25.63 
 
 
566 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.39 
 
 
573 aa  161  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  25.13 
 
 
573 aa  160  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.26 
 
 
588 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.39 
 
 
573 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  26.06 
 
 
623 aa  158  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.57 
 
 
596 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.03 
 
 
554 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.19 
 
 
554 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.47 
 
 
566 aa  156  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.39 
 
 
579 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.73 
 
 
566 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  25.22 
 
 
573 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.26 
 
 
556 aa  153  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.37 
 
 
574 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  24.82 
 
 
587 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.28 
 
 
572 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.3 
 
 
552 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.04 
 
 
574 aa  149  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25 
 
 
563 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.4 
 
 
566 aa  148  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.28 
 
 
574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  26.97 
 
 
553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  27.35 
 
 
552 aa  147  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.89 
 
 
586 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.27 
 
 
557 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.35 
 
 
636 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.37 
 
 
565 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  26.9 
 
 
552 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.39 
 
 
535 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.73 
 
 
574 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.7 
 
 
555 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.54 
 
 
574 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.23 
 
 
598 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.55 
 
 
574 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  30.62 
 
 
531 aa  143  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.82 
 
 
557 aa  143  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.79 
 
 
572 aa  143  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>