More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0899 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  78.1 
 
 		 515 aa  752    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1073    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  76.07 
 
 		 515 aa  715    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  56.78 
 
 		 514 aa  558  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  59.03 
 
 		 515 aa  552  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  59.34 
 
 		 514 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  59.73 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  58.88 
 
 		 515 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  57.86 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  57.39 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  58.41 
 
 		 512 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  52.15 
 
 		 552 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  55.08 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  53.5 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  52.8 
 
 		 513 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  52.88 
 
 		 531 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  51.76 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  52.04 
 
 		 518 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  54.3 
 
 		 519 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  51.85 
 
 		 518 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  51.27 
 
 		 551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  53.18 
 
 		 516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  52.62 
 
 		 519 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  50.87 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  51.65 
 
 		 518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  51.46 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  47.66 
 
 		 553 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  51.15 
 
 		 531 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  50.58 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  51.15 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  53.29 
 
 		 519 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  48.74 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  49.34 
 
 		 529 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  50.97 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  50.87 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  48.64 
 
 		 513 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  48.94 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  45.92 
 
 		 526 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  36.55 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  33.59 
 
 		 652 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.49 
 
 		 568 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.74 
 
 		 589 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  28.98 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  28.73 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.37 
 
 		 545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  28.36 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  27.51 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  26.65 
 
 		 525 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.79 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  27.31 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  26.59 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  26.38 
 
 		 535 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  26.2 
 
 		 535 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.11 
 
 		 536 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  26.56 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.67 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.73 
 
 		 559 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  36.78 
 
 		 527 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  24.91 
 
 		 548 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  28.09 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  24.95 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  24.91 
 
 		 547 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 499 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  26.06 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  27.77 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  24.04 
 
 		 563 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  24.23 
 
 		 552 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.62 
 
 		 565 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  27.34 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  26.51 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  24.73 
 
 		 547 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  25.33 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  22.16 
 
 		 550 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  23.94 
 
 		 546 aa  101  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  24.32 
 
 		 549 aa  101  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  24.63 
 
 		 547 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  32.77 
 
 		 554 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  23.57 
 
 		 546 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  22.58 
 
 		 550 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  23.18 
 
 		 550 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  23.71 
 
 		 545 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  23.57 
 
 		 546 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  23.39 
 
 		 546 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  24.59 
 
 		 547 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.12 
 
 		 561 aa  97.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.32 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  24.4 
 
 		 547 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  24.4 
 
 		 547 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  24.4 
 
 		 547 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0140  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24 
 
 		 565 aa  96.7  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  24.4 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  23.71 
 
 		 550 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  23.71 
 
 		 550 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  24.4 
 
 		 547 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  24.4 
 
 		 547 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  23.95 
 
 		 550 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.31 
 
 		 658 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  26.09 
 
 		 518 aa  94  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.46 
 
 		 570 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>