More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0092 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  100 
 
 
561 aa  1137    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  59.82 
 
 
565 aa  634  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  58.97 
 
 
572 aa  633  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  50.44 
 
 
566 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.51 
 
 
554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.45 
 
 
562 aa  253  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.87 
 
 
562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.75 
 
 
562 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.7 
 
 
559 aa  239  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  29.69 
 
 
589 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.77 
 
 
568 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.51 
 
 
545 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.2 
 
 
562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.88 
 
 
658 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  31.14 
 
 
536 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.98 
 
 
499 aa  200  6e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.22 
 
 
536 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  31.52 
 
 
535 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  31.31 
 
 
535 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  31.42 
 
 
535 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  28.78 
 
 
540 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  29.66 
 
 
535 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  28.37 
 
 
518 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  29.66 
 
 
535 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  29.93 
 
 
539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  27.86 
 
 
542 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  30.4 
 
 
542 aa  183  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  27.65 
 
 
529 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  30.84 
 
 
539 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  31.02 
 
 
539 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  26.84 
 
 
537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  28.88 
 
 
548 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  29.01 
 
 
540 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  30.66 
 
 
539 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  30.66 
 
 
539 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  30.66 
 
 
539 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  30.66 
 
 
539 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  30.66 
 
 
539 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.97 
 
 
542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.85 
 
 
540 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  28.47 
 
 
540 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.01 
 
 
551 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  27.98 
 
 
529 aa  171  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.02 
 
 
566 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.17 
 
 
533 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  28.1 
 
 
578 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  28.49 
 
 
533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  26.84 
 
 
529 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  28.67 
 
 
528 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1108  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.38 
 
 
489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0811747  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.29 
 
 
565 aa  156  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  26.49 
 
 
549 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  26.62 
 
 
535 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  27.68 
 
 
551 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  26.67 
 
 
528 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.15 
 
 
557 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.77 
 
 
559 aa  154  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.68 
 
 
563 aa  154  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.62 
 
 
558 aa  153  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.39 
 
 
585 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  28.34 
 
 
552 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.3 
 
 
582 aa  150  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.88 
 
 
596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  28.44 
 
 
540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  33.84 
 
 
527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  24.55 
 
 
566 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.12 
 
 
591 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29 
 
 
615 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.12 
 
 
591 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.42 
 
 
601 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.17 
 
 
592 aa  146  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.49 
 
 
535 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.22 
 
 
554 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.5 
 
 
600 aa  146  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  26.94 
 
 
576 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.48 
 
 
588 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.27 
 
 
601 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.25 
 
 
563 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  26.09 
 
 
528 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  25.82 
 
 
599 aa  144  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.3 
 
 
592 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.92 
 
 
561 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.47 
 
 
554 aa  144  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.94 
 
 
591 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.59 
 
 
604 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.88 
 
 
592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27 
 
 
585 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  25.74 
 
 
587 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.32 
 
 
552 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.36 
 
 
555 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.65 
 
 
572 aa  140  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.09 
 
 
592 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.18 
 
 
503 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.42 
 
 
593 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  26.99 
 
 
518 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.31 
 
 
578 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.66 
 
 
600 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.91 
 
 
574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  25.69 
 
 
587 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>