More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6157 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  100 
 
 		 537 aa  1076    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  70.51 
 
 		 539 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  69.92 
 
 		 539 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  70.12 
 
 		 539 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  75.33 
 
 		 535 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  74.16 
 
 		 535 aa  779    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  70.12 
 
 		 539 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  70.94 
 
 		 539 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  74.62 
 
 		 529 aa  758    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  72.83 
 
 		 536 aa  761    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  67.69 
 
 		 548 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  75.28 
 
 		 535 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  75.05 
 
 		 535 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  73.97 
 
 		 535 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  70.51 
 
 		 539 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  68.44 
 
 		 529 aa  721    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  70.51 
 
 		 539 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  70.51 
 
 		 539 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  56.92 
 
 		 518 aa  578  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  53.63 
 
 		 533 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  53.47 
 
 		 551 aa  530  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  53.17 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  51.15 
 
 		 542 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  52.92 
 
 		 540 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  50.2 
 
 		 540 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  49.52 
 
 		 527 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.69 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  47.27 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  47.51 
 
 		 528 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.28 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.49 
 
 		 540 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  46.64 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  45.52 
 
 		 528 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  45.32 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  45.02 
 
 		 525 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.75 
 
 		 533 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  43.3 
 
 		 529 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  38.88 
 
 		 535 aa  362  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  40.04 
 
 		 540 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.21 
 
 		 554 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.34 
 
 		 562 aa  267  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 562 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.34 
 
 		 562 aa  264  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 562 aa  243  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  33.76 
 
 		 545 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.31 
 
 		 658 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.75 
 
 		 559 aa  213  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.41 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.26 
 
 		 568 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  27.88 
 
 		 589 aa  196  6e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.57 
 
 		 561 aa  183  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  30.27 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  27.92 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.84 
 
 		 557 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.19 
 
 		 566 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.39 
 
 		 566 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.03 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.62 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.74 
 
 		 566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  28.28 
 
 		 574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  28.28 
 
 		 574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.84 
 
 		 566 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.81 
 
 		 584 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.28 
 
 		 574 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.79 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.16 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.97 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.52 
 
 		 574 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.47 
 
 		 565 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.28 
 
 		 574 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.28 
 
 		 574 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.28 
 
 		 574 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.16 
 
 		 584 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.82 
 
 		 563 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  26.25 
 
 		 552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.26 
 
 		 573 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.62 
 
 		 573 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.34 
 
 		 563 aa  170  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.09 
 
 		 604 aa  170  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  27.59 
 
 		 578 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.66 
 
 		 554 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  28.23 
 
 		 562 aa  169  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.58 
 
 		 575 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.58 
 
 		 575 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.58 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.97 
 
 		 572 aa  169  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.61 
 
 		 572 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.9 
 
 		 565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.9 
 
 		 556 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.94 
 
 		 574 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  27.76 
 
 		 623 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.16 
 
 		 572 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.94 
 
 		 574 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.91 
 
 		 569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.09 
 
 		 588 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.65 
 
 		 574 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.78 
 
 		 572 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  26.11 
 
 		 551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 		 572 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.99 
 
 		 558 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>