More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2776 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  57.44 
 
 
533 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  100 
 
 
535 aa  1096    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  51.67 
 
 
540 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.79 
 
 
536 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  44.73 
 
 
542 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  39.81 
 
 
528 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  39.44 
 
 
529 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  39.81 
 
 
549 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  40.08 
 
 
528 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  41.33 
 
 
528 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.31 
 
 
551 aa  372  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  39.5 
 
 
525 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  38.18 
 
 
537 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  41.41 
 
 
527 aa  349  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  38.31 
 
 
542 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  39.07 
 
 
539 aa  346  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  39.12 
 
 
540 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  37.83 
 
 
540 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  39.03 
 
 
539 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  38.69 
 
 
529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  39.03 
 
 
539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  39.03 
 
 
539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  39.03 
 
 
539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  39.03 
 
 
539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  38.12 
 
 
529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  38.83 
 
 
539 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  38.83 
 
 
539 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  37.69 
 
 
548 aa  333  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  36.95 
 
 
540 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  37.11 
 
 
518 aa  332  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  38.04 
 
 
536 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  35.62 
 
 
533 aa  327  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  36.98 
 
 
535 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  36.79 
 
 
535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  37.21 
 
 
535 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  36.67 
 
 
535 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  36.7 
 
 
535 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.97 
 
 
499 aa  286  7e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  35.17 
 
 
540 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  30.95 
 
 
554 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.16 
 
 
562 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.16 
 
 
562 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.49 
 
 
545 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.55 
 
 
562 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.47 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.22 
 
 
562 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.88 
 
 
658 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1108  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.57 
 
 
489 aa  170  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0811747  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.01 
 
 
559 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.41 
 
 
589 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.04 
 
 
568 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.62 
 
 
561 aa  153  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.18 
 
 
566 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.78 
 
 
565 aa  140  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.99 
 
 
566 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  25.97 
 
 
572 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.42 
 
 
542 aa  137  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  24.95 
 
 
551 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.16 
 
 
566 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.14 
 
 
566 aa  113  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  22.93 
 
 
566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  23.5 
 
 
552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  23.67 
 
 
595 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  23.08 
 
 
573 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  22.91 
 
 
549 aa  109  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  23.49 
 
 
595 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.49 
 
 
595 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.05 
 
 
549 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.77 
 
 
600 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.23 
 
 
565 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  21.26 
 
 
576 aa  104  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.79 
 
 
563 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  24.03 
 
 
562 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.4 
 
 
562 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.22 
 
 
573 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  21.8 
 
 
566 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.32 
 
 
574 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  22.68 
 
 
573 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0816  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.4 
 
 
558 aa  97.8  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.76 
 
 
563 aa  97.8  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.26 
 
 
588 aa  97.1  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.26 
 
 
554 aa  97.1  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.12 
 
 
557 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.29 
 
 
557 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.32 
 
 
547 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00325179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.53 
 
 
557 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.78 
 
 
584 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.95 
 
 
564 aa  95.9  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  23.74 
 
 
555 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  21.61 
 
 
578 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  23.77 
 
 
575 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  22.65 
 
 
591 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  23.58 
 
 
567 aa  94  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.74 
 
 
556 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  23.16 
 
 
623 aa  94  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.78 
 
 
584 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.74 
 
 
573 aa  93.6  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  20.9 
 
 
573 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  23.08 
 
 
592 aa  93.6  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  24.63 
 
 
518 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>