More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4867 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  100 
 
 
591 aa  1224    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  72.01 
 
 
602 aa  900    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4214  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  80.78 
 
 
591 aa  1029    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169445  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  71.89 
 
 
592 aa  883    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.42 
 
 
593 aa  956    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1828  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.08 
 
 
593 aa  947    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.902523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  85.71 
 
 
591 aa  1073    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  71.72 
 
 
592 aa  882    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2846  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  71.86 
 
 
593 aa  894    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114516  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  74.96 
 
 
592 aa  935    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1010  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.93 
 
 
593 aa  967    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1642  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  78.1 
 
 
593 aa  967    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4277  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  78.1 
 
 
593 aa  967    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268033  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.9 
 
 
610 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.55 
 
 
610 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.3 
 
 
616 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.69 
 
 
605 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.13 
 
 
610 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.19 
 
 
605 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.13 
 
 
603 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.78 
 
 
607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.09 
 
 
603 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.92 
 
 
605 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  39.38 
 
 
578 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  37.59 
 
 
580 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  39.21 
 
 
580 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.86 
 
 
580 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.62 
 
 
581 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  29.78 
 
 
599 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.83 
 
 
554 aa  253  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.35 
 
 
555 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.45 
 
 
556 aa  249  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.29 
 
 
563 aa  249  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.47 
 
 
566 aa  248  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.27 
 
 
561 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 
557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.21 
 
 
562 aa  243  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.05 
 
 
552 aa  243  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 
588 aa  240  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  28.08 
 
 
587 aa  239  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.84 
 
 
636 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.57 
 
 
608 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.54 
 
 
572 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.54 
 
 
572 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.54 
 
 
572 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.07 
 
 
558 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.38 
 
 
570 aa  236  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.34 
 
 
572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.95 
 
 
572 aa  236  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.42 
 
 
574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.24 
 
 
599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 
587 aa  233  9e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.72 
 
 
557 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  29.45 
 
 
554 aa  232  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.98 
 
 
558 aa  231  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.42 
 
 
573 aa  231  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  27.16 
 
 
587 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 
587 aa  230  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.62 
 
 
557 aa  230  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  27.7 
 
 
542 aa  230  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.52 
 
 
569 aa  230  7e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  28 
 
 
552 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.83 
 
 
553 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.16 
 
 
581 aa  229  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.14 
 
 
572 aa  227  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.62 
 
 
573 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.98 
 
 
582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  28.16 
 
 
551 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.11 
 
 
567 aa  226  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.07 
 
 
563 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.28 
 
 
555 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.45 
 
 
558 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.34 
 
 
572 aa  225  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.27 
 
 
573 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.62 
 
 
581 aa  224  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.21 
 
 
565 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.5 
 
 
572 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.46 
 
 
552 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.67 
 
 
572 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.74 
 
 
559 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.47 
 
 
572 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.61 
 
 
572 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.98 
 
 
618 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.13 
 
 
554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.26 
 
 
623 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  26.94 
 
 
555 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  27.35 
 
 
575 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.14 
 
 
573 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.49 
 
 
572 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.82 
 
 
581 aa  220  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.4 
 
 
597 aa  220  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  29.64 
 
 
576 aa  220  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.88 
 
 
559 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.63 
 
 
572 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.63 
 
 
572 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.34 
 
 
535 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  27.52 
 
 
581 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.62 
 
 
574 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.32 
 
 
572 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.57 
 
 
573 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>