More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1828 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.38 
 
 
592 aa  941    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  72.45 
 
 
602 aa  898    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.83 
 
 
593 aa  971    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2846  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  76.73 
 
 
593 aa  939    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114516  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.04 
 
 
592 aa  939    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4214  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  74.66 
 
 
591 aa  951    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169445  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1828  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  100 
 
 
593 aa  1226    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.902523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  78.68 
 
 
592 aa  957    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.72 
 
 
591 aa  950    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1010  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.33 
 
 
593 aa  971    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1642  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.5 
 
 
593 aa  971    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4277  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.5 
 
 
593 aa  971    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268033  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.08 
 
 
591 aa  947    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.64 
 
 
605 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.88 
 
 
610 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.47 
 
 
616 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.97 
 
 
605 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.05 
 
 
610 aa  535  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.14 
 
 
603 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.14 
 
 
610 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.56 
 
 
607 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.23 
 
 
605 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.19 
 
 
603 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  39.38 
 
 
578 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.87 
 
 
581 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  37.8 
 
 
580 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  37.52 
 
 
580 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  37.11 
 
 
580 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.58 
 
 
552 aa  243  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.96 
 
 
554 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  29.02 
 
 
552 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  28.3 
 
 
551 aa  236  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.06 
 
 
555 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.42 
 
 
557 aa  233  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.55 
 
 
566 aa  232  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.87 
 
 
555 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.98 
 
 
588 aa  230  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.16 
 
 
558 aa  229  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.42 
 
 
554 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.04 
 
 
559 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.76 
 
 
558 aa  229  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.57 
 
 
581 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.69 
 
 
563 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.33 
 
 
629 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.97 
 
 
557 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.08 
 
 
565 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  29.26 
 
 
599 aa  226  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.24 
 
 
553 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.84 
 
 
556 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.66 
 
 
561 aa  224  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.78 
 
 
566 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  28.49 
 
 
562 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  27.36 
 
 
554 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.8 
 
 
586 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.32 
 
 
620 aa  220  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  28.44 
 
 
554 aa  220  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29 
 
 
623 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.45 
 
 
627 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.81 
 
 
619 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.81 
 
 
619 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.81 
 
 
619 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.6 
 
 
611 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.51 
 
 
620 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  28.1 
 
 
626 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.28 
 
 
535 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.98 
 
 
587 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  30.66 
 
 
578 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  27.11 
 
 
587 aa  217  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.58 
 
 
564 aa  217  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.32 
 
 
581 aa  217  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.12 
 
 
625 aa  217  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.42 
 
 
557 aa  217  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.15 
 
 
563 aa  216  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  30.81 
 
 
576 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26.35 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  27.69 
 
 
554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.42 
 
 
561 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.83 
 
 
552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.96 
 
 
581 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.19 
 
 
567 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.71 
 
 
562 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  26.25 
 
 
581 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  27.49 
 
 
575 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.56 
 
 
589 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.97 
 
 
636 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.03 
 
 
586 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.24 
 
 
561 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.81 
 
 
572 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.81 
 
 
572 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.09 
 
 
562 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.74 
 
 
559 aa  211  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  26.18 
 
 
587 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.52 
 
 
597 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1710  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.37 
 
 
615 aa  210  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.55 
 
 
568 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.54 
 
 
566 aa  210  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.05 
 
 
572 aa  210  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.89 
 
 
568 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.74 
 
 
562 aa  209  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  27.92 
 
 
562 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>