More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4214 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1828  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  74.66 
 
 
593 aa  951    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.902523 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  76.69 
 
 
593 aa  951    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  83.33 
 
 
591 aa  1048    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  80.78 
 
 
591 aa  1029    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2846  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  70.49 
 
 
593 aa  886    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114516  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4214  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  100 
 
 
591 aa  1222    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169445  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  71.21 
 
 
592 aa  877    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.21 
 
 
592 aa  942    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  71.04 
 
 
592 aa  876    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  73.72 
 
 
602 aa  913    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1010  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.34 
 
 
593 aa  948    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1642  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.17 
 
 
593 aa  947    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4277  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.17 
 
 
593 aa  947    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268033  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  47.24 
 
 
610 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  47.41 
 
 
610 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.05 
 
 
605 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.38 
 
 
616 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.38 
 
 
605 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.55 
 
 
610 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.55 
 
 
603 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.3 
 
 
607 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.47 
 
 
605 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.61 
 
 
603 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.86 
 
 
578 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  39.11 
 
 
580 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  39.21 
 
 
580 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  39.04 
 
 
581 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  39.21 
 
 
580 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.01 
 
 
554 aa  247  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  29 
 
 
552 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.47 
 
 
563 aa  242  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.98 
 
 
555 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.31 
 
 
566 aa  238  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.6 
 
 
552 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.8 
 
 
556 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.62 
 
 
561 aa  238  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  29.29 
 
 
599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.24 
 
 
557 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  28.3 
 
 
551 aa  233  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 
557 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.45 
 
 
565 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  28.8 
 
 
562 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.41 
 
 
558 aa  230  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.76 
 
 
554 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.67 
 
 
572 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.67 
 
 
572 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.86 
 
 
553 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  28.29 
 
 
587 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.78 
 
 
559 aa  225  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  31.17 
 
 
576 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.26 
 
 
552 aa  224  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  28.47 
 
 
587 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  27.62 
 
 
587 aa  223  6e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.99 
 
 
557 aa  223  8e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.4 
 
 
569 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  28.47 
 
 
587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.56 
 
 
558 aa  221  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.84 
 
 
555 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.45 
 
 
555 aa  220  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.47 
 
 
535 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.29 
 
 
569 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.46 
 
 
556 aa  219  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.02 
 
 
593 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 
563 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.03 
 
 
581 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.18 
 
 
629 aa  219  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.93 
 
 
569 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  29.6 
 
 
554 aa  218  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  27.27 
 
 
542 aa  217  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.76 
 
 
567 aa  217  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.8 
 
 
566 aa  216  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  28.37 
 
 
578 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.7 
 
 
563 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.78 
 
 
573 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.92 
 
 
572 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.55 
 
 
581 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  28.75 
 
 
569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.27 
 
 
559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.41 
 
 
573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.01 
 
 
566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.84 
 
 
574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.02 
 
 
563 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.75 
 
 
572 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.75 
 
 
572 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  28.94 
 
 
578 aa  213  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.94 
 
 
599 aa  213  7.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.98 
 
 
558 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.96 
 
 
618 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.64 
 
 
612 aa  213  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.75 
 
 
572 aa  213  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.38 
 
 
608 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.01 
 
 
581 aa  212  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.18 
 
 
563 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.84 
 
 
572 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.41 
 
 
573 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.43 
 
 
542 aa  211  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.98 
 
 
611 aa  210  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.88 
 
 
636 aa  210  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.2 
 
 
570 aa  210  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>