More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1642 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  76.57 
 
 
591 aa  966    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4214  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.17 
 
 
591 aa  947    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169445  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  73.76 
 
 
602 aa  897    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  91.74 
 
 
593 aa  1134    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1828  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.5 
 
 
593 aa  971    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.902523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  74.49 
 
 
592 aa  924    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  78.1 
 
 
591 aa  967    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2846  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  73.94 
 
 
593 aa  922    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114516  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  76.44 
 
 
592 aa  937    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.13 
 
 
592 aa  924    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1010  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  99.83 
 
 
593 aa  1221    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1642  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  100 
 
 
593 aa  1222    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4277  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  100 
 
 
593 aa  1222    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.55 
 
 
610 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.21 
 
 
610 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.7 
 
 
605 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.21 
 
 
616 aa  525  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.34 
 
 
605 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.86 
 
 
603 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.86 
 
 
610 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.27 
 
 
607 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.78 
 
 
605 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.23 
 
 
603 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  39.14 
 
 
578 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.14 
 
 
580 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.55 
 
 
581 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.97 
 
 
580 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.79 
 
 
580 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.27 
 
 
556 aa  240  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.09 
 
 
561 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.9 
 
 
566 aa  237  4e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  28.73 
 
 
562 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.98 
 
 
557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.15 
 
 
555 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  28.7 
 
 
552 aa  233  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  27.93 
 
 
599 aa  229  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.56 
 
 
554 aa  228  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.33 
 
 
559 aa  228  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  28.36 
 
 
554 aa  228  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.85 
 
 
555 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.08 
 
 
557 aa  226  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.42 
 
 
552 aa  225  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.96 
 
 
553 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.8 
 
 
563 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.67 
 
 
572 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  27.94 
 
 
551 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.75 
 
 
629 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.11 
 
 
558 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.7 
 
 
554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.39 
 
 
558 aa  220  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.01 
 
 
565 aa  220  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.08 
 
 
573 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.35 
 
 
581 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.2 
 
 
627 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  26.03 
 
 
587 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.11 
 
 
620 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 
569 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.44 
 
 
572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.08 
 
 
587 aa  218  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26.08 
 
 
587 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.44 
 
 
572 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.13 
 
 
588 aa  217  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.44 
 
 
572 aa  217  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.08 
 
 
557 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.03 
 
 
586 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.72 
 
 
572 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.35 
 
 
559 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.64 
 
 
611 aa  216  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.35 
 
 
572 aa  216  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.63 
 
 
564 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.29 
 
 
623 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  26.26 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.42 
 
 
572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  29.82 
 
 
576 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3392  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.78 
 
 
585 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.92 
 
 
618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.55 
 
 
572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.42 
 
 
572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.42 
 
 
572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  28.96 
 
 
581 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.55 
 
 
572 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.43 
 
 
586 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.85 
 
 
574 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.11 
 
 
563 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.09 
 
 
599 aa  212  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.14 
 
 
636 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  27.8 
 
 
554 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.87 
 
 
555 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.07 
 
 
535 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  28.39 
 
 
572 aa  210  7e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.54 
 
 
570 aa  210  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.19 
 
 
574 aa  210  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.25 
 
 
572 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.83 
 
 
581 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  28.93 
 
 
564 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.21 
 
 
608 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.34 
 
 
597 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.32 
 
 
598 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.82 
 
 
573 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.04 
 
 
573 aa  208  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>