More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0155 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4214  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  75.21 
 
 
591 aa  942    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169445  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1828  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  78.68 
 
 
593 aa  957    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.902523 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  77.12 
 
 
593 aa  936    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  82.91 
 
 
592 aa  1010    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2846  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  83.14 
 
 
593 aa  1028    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114516  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  82.91 
 
 
592 aa  1011    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  73.85 
 
 
591 aa  924    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  100 
 
 
592 aa  1218    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  74.96 
 
 
591 aa  935    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  73.59 
 
 
602 aa  901    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1010  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  76.61 
 
 
593 aa  938    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1642  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  76.44 
 
 
593 aa  937    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4277  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  76.44 
 
 
593 aa  937    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.61 
 
 
610 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.09 
 
 
610 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.75 
 
 
616 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.58 
 
 
605 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.6 
 
 
605 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.6 
 
 
610 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.6 
 
 
603 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.52 
 
 
605 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.5 
 
 
607 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  43.3 
 
 
603 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  40.86 
 
 
578 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.91 
 
 
581 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  37.35 
 
 
580 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.28 
 
 
580 aa  363  6e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  38.1 
 
 
580 aa  363  6e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  29.41 
 
 
552 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.62 
 
 
557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.31 
 
 
556 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.13 
 
 
561 aa  231  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.57 
 
 
555 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  28.29 
 
 
551 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.98 
 
 
563 aa  228  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.19 
 
 
565 aa  225  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.99 
 
 
566 aa  223  6e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  31.9 
 
 
576 aa  223  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.18 
 
 
554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.13 
 
 
573 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.83 
 
 
636 aa  216  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.49 
 
 
552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  30.97 
 
 
578 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.1 
 
 
570 aa  212  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.46 
 
 
559 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.6 
 
 
555 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.77 
 
 
608 aa  211  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  27.93 
 
 
562 aa  211  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.01 
 
 
563 aa  210  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.52 
 
 
581 aa  210  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.79 
 
 
558 aa  210  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.45 
 
 
569 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  27.61 
 
 
554 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.96 
 
 
562 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.44 
 
 
572 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.31 
 
 
535 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  27.93 
 
 
599 aa  208  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.03 
 
 
553 aa  208  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  28.65 
 
 
554 aa  208  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.83 
 
 
557 aa  208  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.56 
 
 
588 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.92 
 
 
572 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.92 
 
 
572 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.08 
 
 
572 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.92 
 
 
572 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.3 
 
 
573 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  27.1 
 
 
575 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.87 
 
 
572 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.13 
 
 
564 aa  205  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.71 
 
 
566 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.4 
 
 
563 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.93 
 
 
566 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.01 
 
 
558 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  27.16 
 
 
572 aa  204  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  25.86 
 
 
587 aa  204  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  28.72 
 
 
590 aa  204  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.74 
 
 
572 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  27.62 
 
 
566 aa  203  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.9 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.81 
 
 
567 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.35 
 
 
572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  28.52 
 
 
555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  28.01 
 
 
554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.71 
 
 
572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  28.52 
 
 
555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.1 
 
 
574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.09 
 
 
561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.92 
 
 
618 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.2 
 
 
572 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.98 
 
 
566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.57 
 
 
572 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.17 
 
 
559 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.32 
 
 
557 aa  200  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.57 
 
 
572 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.57 
 
 
572 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.68 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  28.02 
 
 
555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.85 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  27.21 
 
 
583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.52 
 
 
573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>