More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3825 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  80 
 
 
610 aa  1031    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  81.79 
 
 
616 aa  1034    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  81.24 
 
 
605 aa  1033    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3825  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  100 
 
 
607 aa  1260    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  79.18 
 
 
610 aa  1029    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1992  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  89.52 
 
 
603 aa  1111    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137247  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  79.51 
 
 
610 aa  1030    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  82.41 
 
 
605 aa  1045    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3999  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  89.46 
 
 
605 aa  1143    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422194  normal  0.0161793 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  80.23 
 
 
603 aa  1031    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  48.81 
 
 
578 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0805  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  47.33 
 
 
592 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.153828  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2045  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  47.33 
 
 
592 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2846  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.66 
 
 
593 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114516  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4214  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.3 
 
 
591 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.169445  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1828  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  46.56 
 
 
593 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.902523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3502  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.81 
 
 
591 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4867  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.78 
 
 
591 aa  525  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.562185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  47.73 
 
 
581 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1010  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.09 
 
 
593 aa  519  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1642  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.27 
 
 
593 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4277  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.27 
 
 
593 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268033  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4011  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.53 
 
 
593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0930701  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0760  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.92 
 
 
602 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.01 
 
 
580 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0155  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  44.5 
 
 
592 aa  495  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.316464  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.59 
 
 
580 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  45.59 
 
 
580 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.75 
 
 
554 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.49 
 
 
554 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.8 
 
 
553 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.23 
 
 
552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  28.35 
 
 
552 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.11 
 
 
566 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.56 
 
 
572 aa  248  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.16 
 
 
569 aa  248  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.43 
 
 
566 aa  247  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.31 
 
 
559 aa  247  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.64 
 
 
588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.18 
 
 
572 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.18 
 
 
572 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.4 
 
 
556 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.03 
 
 
558 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  29.89 
 
 
566 aa  241  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.23 
 
 
535 aa  241  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.4 
 
 
581 aa  240  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.79 
 
 
562 aa  240  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.11 
 
 
565 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1710  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.94 
 
 
615 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.72 
 
 
601 aa  238  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 
557 aa  238  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.43 
 
 
581 aa  237  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.84 
 
 
563 aa  237  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.44 
 
 
573 aa  237  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.65 
 
 
555 aa  237  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.74 
 
 
576 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.55 
 
 
582 aa  236  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.53 
 
 
566 aa  236  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.7 
 
 
594 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.7 
 
 
593 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.18 
 
 
562 aa  236  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.2 
 
 
564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.99 
 
 
564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.27 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.73 
 
 
573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.69 
 
 
563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.39 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 
556 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.87 
 
 
561 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.01 
 
 
555 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.08 
 
 
566 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.86 
 
 
574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.38 
 
 
563 aa  234  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.26 
 
 
574 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.22 
 
 
557 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.41 
 
 
566 aa  233  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.45 
 
 
593 aa  232  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.06 
 
 
574 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  29.17 
 
 
567 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.52 
 
 
607 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.72 
 
 
581 aa  233  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  28.73 
 
 
555 aa  233  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.48 
 
 
566 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.87 
 
 
571 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.42 
 
 
623 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.98 
 
 
588 aa  230  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.69 
 
 
558 aa  230  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.84 
 
 
620 aa  230  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.77 
 
 
592 aa  230  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.14 
 
 
618 aa  230  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.84 
 
 
552 aa  230  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.83 
 
 
574 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.7 
 
 
574 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.45 
 
 
561 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.24 
 
 
593 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29 
 
 
586 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.95 
 
 
569 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.17 
 
 
560 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1753  acetolactate synthase, large subunit  29.51 
 
 
590 aa  228  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00232913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.29 
 
 
559 aa  229  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>