More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0451 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  77.68 
 
 
549 aa  896    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  100 
 
 
549 aa  1110    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  34.26 
 
 
542 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2652  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.34 
 
 
586 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.14 
 
 
557 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.8 
 
 
535 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  33.64 
 
 
622 aa  266  8e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.58 
 
 
582 aa  266  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.41 
 
 
593 aa  265  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.54 
 
 
552 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.22 
 
 
561 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 
562 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.25 
 
 
554 aa  263  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.92 
 
 
574 aa  261  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.55 
 
 
566 aa  260  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.79 
 
 
557 aa  260  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.1 
 
 
574 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.55 
 
 
566 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.48 
 
 
571 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
569 aa  258  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.03 
 
 
566 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.98 
 
 
571 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  32.73 
 
 
566 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.88 
 
 
556 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.88 
 
 
561 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1613  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.79 
 
 
558 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.48 
 
 
573 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.6 
 
 
565 aa  258  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  31.88 
 
 
566 aa  258  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.56 
 
 
588 aa  257  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.43 
 
 
574 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.24 
 
 
566 aa  256  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  31.25 
 
 
573 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.41 
 
 
569 aa  255  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.35 
 
 
570 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.14 
 
 
573 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.1 
 
 
574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  30.02 
 
 
555 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.74 
 
 
571 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.35 
 
 
570 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.35 
 
 
570 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.16 
 
 
581 aa  254  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.35 
 
 
570 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.64 
 
 
573 aa  254  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.04 
 
 
573 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.5 
 
 
555 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.63 
 
 
572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.61 
 
 
571 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.45 
 
 
573 aa  253  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.51 
 
 
604 aa  253  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.43 
 
 
555 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.82 
 
 
573 aa  253  8.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  31.35 
 
 
623 aa  253  8.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.68 
 
 
562 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.45 
 
 
556 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.76 
 
 
620 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.51 
 
 
566 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32 
 
 
566 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.84 
 
 
574 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.42 
 
 
570 aa  251  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.68 
 
 
627 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.8 
 
 
581 aa  250  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.59 
 
 
553 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.31 
 
 
563 aa  250  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.5 
 
 
572 aa  250  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  31.59 
 
 
560 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.84 
 
 
574 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.16 
 
 
573 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.45 
 
 
566 aa  249  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.43 
 
 
573 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  31.19 
 
 
549 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  30.5 
 
 
569 aa  249  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  31.12 
 
 
587 aa  248  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.61 
 
 
574 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.56 
 
 
572 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  31.51 
 
 
573 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.29 
 
 
615 aa  248  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.74 
 
 
572 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.56 
 
 
572 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.74 
 
 
572 aa  247  4e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  31.42 
 
 
572 aa  247  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.56 
 
 
572 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.84 
 
 
542 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 
559 aa  246  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.11 
 
 
636 aa  246  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.02 
 
 
574 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  30.47 
 
 
581 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.02 
 
 
574 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.45 
 
 
573 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.91 
 
 
566 aa  246  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.3 
 
 
554 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  32.02 
 
 
574 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.02 
 
 
574 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  32.02 
 
 
574 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.05 
 
 
558 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.01 
 
 
629 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.26 
 
 
620 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.9 
 
 
604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.86 
 
 
618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.13 
 
 
569 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>