More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1115 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  100 
 
 
566 aa  1125    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  55.38 
 
 
572 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  55.28 
 
 
565 aa  555  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  50.44 
 
 
561 aa  536  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.62 
 
 
554 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.65 
 
 
658 aa  236  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.62 
 
 
545 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.3 
 
 
562 aa  233  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.49 
 
 
568 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.62 
 
 
562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.5 
 
 
562 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  28.62 
 
 
589 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  33.87 
 
 
536 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  33.45 
 
 
535 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  33.27 
 
 
535 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  32.08 
 
 
535 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  32.25 
 
 
535 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.8 
 
 
536 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.98 
 
 
559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  32.08 
 
 
527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  30.84 
 
 
529 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.65 
 
 
540 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.8 
 
 
562 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  30.67 
 
 
537 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  29.68 
 
 
518 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  30.86 
 
 
529 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  31.39 
 
 
535 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.87 
 
 
533 aa  191  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  32.5 
 
 
539 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.79 
 
 
542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  30.84 
 
 
548 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  30.22 
 
 
528 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  29.03 
 
 
529 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  29.46 
 
 
540 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.93 
 
 
542 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  29.91 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  31.08 
 
 
539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  30.54 
 
 
539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  30.22 
 
 
540 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  30.54 
 
 
539 aa  173  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  29.77 
 
 
549 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  29.82 
 
 
528 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  30.14 
 
 
528 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  28.85 
 
 
542 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  30.09 
 
 
525 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  26.16 
 
 
535 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.06 
 
 
596 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.91 
 
 
566 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.19 
 
 
551 aa  161  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.92 
 
 
563 aa  161  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.97 
 
 
588 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  30.76 
 
 
578 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.77 
 
 
601 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.82 
 
 
592 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.64 
 
 
499 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  29.98 
 
 
540 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.43 
 
 
567 aa  152  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.16 
 
 
592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.04 
 
 
591 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.86 
 
 
591 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.34 
 
 
585 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.86 
 
 
591 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.98 
 
 
592 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.82 
 
 
584 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.71 
 
 
558 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.48 
 
 
503 aa  147  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.04 
 
 
554 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.65 
 
 
584 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.78 
 
 
600 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.76 
 
 
557 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2802  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.57 
 
 
585 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34708  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.68 
 
 
583 aa  143  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.09 
 
 
592 aa  143  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.23 
 
 
562 aa  143  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  26.22 
 
 
542 aa  143  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.51 
 
 
565 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.04 
 
 
607 aa  143  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.63 
 
 
555 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.11 
 
 
566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.74 
 
 
563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.99 
 
 
563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.87 
 
 
591 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.32 
 
 
593 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  27.34 
 
 
554 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1526  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.41 
 
 
652 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.7 
 
 
552 aa  140  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.2 
 
 
566 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.8 
 
 
601 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.77 
 
 
566 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2532  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.35 
 
 
596 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630898  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.26 
 
 
572 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.57 
 
 
592 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.7 
 
 
586 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  24.31 
 
 
558 aa  139  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  25.69 
 
 
584 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  25.41 
 
 
566 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  27.89 
 
 
576 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2791  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.26 
 
 
596 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.823193 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  26.57 
 
 
595 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  24.83 
 
 
572 aa  137  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>