More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2090 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  80.69 
 
 		 518 aa  843    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  65.56 
 
 		 514 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1042    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  80.5 
 
 		 518 aa  815    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  58.22 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  54.56 
 
 		 513 aa  498  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  55.81 
 
 		 519 aa  488  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  52.42 
 
 		 552 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  51.16 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  52.23 
 
 		 519 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  51.54 
 
 		 551 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  51.25 
 
 		 555 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  51.36 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  52.35 
 
 		 514 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  53.02 
 
 		 515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  52.42 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  50.19 
 
 		 515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  51.36 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  52.85 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  52.53 
 
 		 514 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  50.48 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  51.75 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  51.7 
 
 		 531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  51.95 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  51.26 
 
 		 531 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  49.42 
 
 		 514 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  50.97 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  49.43 
 
 		 517 aa  435  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  49.61 
 
 		 516 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  50 
 
 		 514 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  51.76 
 
 		 515 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  52 
 
 		 519 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  45 
 
 		 529 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  44.53 
 
 		 529 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  48.74 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  43.93 
 
 		 527 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  47.95 
 
 		 508 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  42.83 
 
 		 526 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  35.4 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.87 
 
 		 568 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.99 
 
 		 542 aa  177  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  36.54 
 
 		 652 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.56 
 
 		 554 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  28.36 
 
 		 529 aa  154  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.93 
 
 		 551 aa  148  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  26.9 
 
 		 545 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  28 
 
 		 540 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.58 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  27.26 
 
 		 540 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  29.46 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.99 
 
 		 561 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  27.09 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.62 
 
 		 540 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  29.07 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  29.52 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  26.72 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  26.62 
 
 		 518 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  25.18 
 
 		 570 aa  130  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  26.43 
 
 		 536 aa  128  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  25.84 
 
 		 535 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  26.67 
 
 		 539 aa  123  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  26.17 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  25.84 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  23.61 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  28.34 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.05 
 
 		 658 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  26.56 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  26.94 
 
 		 540 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  26.93 
 
 		 525 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.94 
 
 		 542 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  23.51 
 
 		 552 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  28.13 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.67 
 
 		 586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  26.04 
 
 		 533 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  26.29 
 
 		 572 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  24.5 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  24.23 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  25.99 
 
 		 529 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  24.64 
 
 		 554 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 566 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  23.15 
 
 		 552 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.39 
 
 		 565 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  26.19 
 
 		 539 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.88 
 
 		 536 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  24.64 
 
 		 554 aa  106  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  24.3 
 
 		 567 aa  106  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  25.37 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.36 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  26.3 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  27.64 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  25.59 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.64 
 
 		 548 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  36.42 
 
 		 527 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.95 
 
 		 573 aa  103  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  25.14 
 
 		 554 aa  103  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  24.59 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  27.84 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  25.95 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  24.32 
 
 		 562 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  23.66 
 
 		 547 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>