More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3134 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1059    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  79.39 
 
 		 529 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  87.33 
 
 		 529 aa  884    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  53.98 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  47.59 
 
 		 514 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  48.65 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  50.58 
 
 		 537 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  50.68 
 
 		 515 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  50.78 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  48.84 
 
 		 514 aa  448  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  49.23 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  47.1 
 
 		 513 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  50.96 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  49.31 
 
 		 514 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  50.29 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  46.67 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  49.9 
 
 		 514 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  48.07 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  48.64 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  47.06 
 
 		 518 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  46.44 
 
 		 552 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  47.21 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  45.89 
 
 		 517 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  45.4 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  44.32 
 
 		 518 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  45 
 
 		 551 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  44.98 
 
 		 518 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  47.68 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  44.68 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  47.83 
 
 		 531 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  44.85 
 
 		 555 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  45.75 
 
 		 519 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  47.68 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  48.07 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  45.4 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  43.85 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  43.41 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  43.92 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.14 
 
 		 542 aa  170  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  28.28 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  29.05 
 
 		 528 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  32.76 
 
 		 652 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  28.62 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  27.93 
 
 		 549 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  29.24 
 
 		 528 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.02 
 
 		 554 aa  135  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.52 
 
 		 551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  28.2 
 
 		 529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  26.85 
 
 		 540 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  26.15 
 
 		 525 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  26.57 
 
 		 527 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 536 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.81 
 
 		 540 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.14 
 
 		 545 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  24.2 
 
 		 551 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.65 
 
 		 568 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  24.83 
 
 		 572 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  27.69 
 
 		 535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  27.16 
 
 		 536 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  27.5 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  26.43 
 
 		 541 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.51 
 
 		 533 aa  117  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  27.42 
 
 		 558 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  24.4 
 
 		 552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.37 
 
 		 568 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  27.03 
 
 		 575 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  25.75 
 
 		 567 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  26.02 
 
 		 575 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  26.14 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  26.61 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  26.38 
 
 		 540 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  23.94 
 
 		 570 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  27.61 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.5 
 
 		 499 aa  107  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  35.84 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.23 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  24.42 
 
 		 549 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  23.67 
 
 		 561 aa  103  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  26.26 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  26.26 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  26.26 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  26.26 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  26.26 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  23.49 
 
 		 564 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  26.26 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.36 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  26.26 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  23.79 
 
 		 549 aa  101  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.95 
 
 		 549 aa  100  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  25.18 
 
 		 582 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  25.05 
 
 		 576 aa  98.6  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  23.71 
 
 		 562 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  27.68 
 
 		 534 aa  97.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  23.95 
 
 		 562 aa  96.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  23.75 
 
 		 562 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  24.23 
 
 		 562 aa  96.3  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  23.75 
 
 		 562 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.57 
 
 		 562 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  23.57 
 
 		 562 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>