More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1554 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1554  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1029    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.872181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  60.39 
 
 		 514 aa  594  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  58.64 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  55.15 
 
 		 518 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  55.13 
 
 		 518 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2852  hypothetical protein  56.59 
 
 		 515 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2070  hypothetical protein  54.3 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0899  hypothetical protein  53.5 
 
 		 537 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.146101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2713  hypothetical protein  56.7 
 
 		 515 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0107  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  54.65 
 
 		 519 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3384  hypothetical protein  52.33 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.549431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3510  hypothetical protein  53.4 
 
 		 531 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  51.95 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  50.78 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  49.81 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1143  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  50.68 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1545  hypothetical protein  52.18 
 
 		 531 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4594  hypothetical protein  49.32 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.456101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  51.07 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30230  hypothetical protein  50.87 
 
 		 519 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  50.39 
 
 		 551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4260  hypothetical protein  50.1 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  50.19 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5213  hypothetical protein  53.67 
 
 		 519 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72595  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6653  hypothetical protein  50.19 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.895478  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1808  hypothetical protein  49.04 
 
 		 514 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3930  hypothetical protein  51.15 
 
 		 514 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12121  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3688  hypothetical protein  50.87 
 
 		 515 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2118  hypothetical protein  50.29 
 
 		 517 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  47.47 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13543  hypothetical protein  51.07 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.26797e-96  hitchhiker  0.000000374579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3491  hypothetical protein  47.21 
 
 		 529 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.704588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  49.13 
 
 		 513 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2570  hypothetical protein  45.89 
 
 		 529 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3134  hypothetical protein  45.49 
 
 		 527 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673748  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1933  hypothetical protein  48.54 
 
 		 513 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6728  hypothetical protein  47.97 
 
 		 526 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2860  hypothetical protein  47.67 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1601  hypothetical protein  35.8 
 
 		 506 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89681  predicted protein  31.5 
 
 		 652 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.574847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  27.03 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  30.64 
 
 		 525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  29.08 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.75 
 
 		 551 aa  124  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  28.63 
 
 		 528 aa  123  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.81 
 
 		 540 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.88 
 
 		 568 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  24.3 
 
 		 552 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  37.27 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  27.48 
 
 		 572 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.86 
 
 		 658 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.81 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  27.15 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  35.59 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.68 
 
 		 566 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  34.83 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  24.73 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.13 
 
 		 565 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  24.23 
 
 		 552 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  24.16 
 
 		 541 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.24 
 
 		 549 aa  100  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  24.3 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  25.54 
 
 		 556 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  25.37 
 
 		 543 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.03 
 
 		 570 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  33.52 
 
 		 540 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  22.8 
 
 		 599 aa  95.9  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.27 
 
 		 566 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  24.95 
 
 		 543 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  24.29 
 
 		 552 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  38 
 
 		 537 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  36.57 
 
 		 529 aa  94  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  35.98 
 
 		 549 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.82 
 
 		 542 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  35.98 
 
 		 528 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  21.02 
 
 		 549 aa  92  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 536 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  38.51 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  26.53 
 
 		 562 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  24.1 
 
 		 547 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  35.33 
 
 		 545 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  24.87 
 
 		 545 aa  90.5  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1108  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.81 
 
 		 489 aa  90.1  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0811747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  25.54 
 
 		 562 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  25.54 
 
 		 562 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  27.77 
 
 		 558 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  25.54 
 
 		 562 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  25.54 
 
 		 562 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  25.54 
 
 		 562 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  26.22 
 
 		 562 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  40.46 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.22 
 
 		 562 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 562 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  37.84 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  40.46 
 
 		 535 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  39.69 
 
 		 535 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  40.91 
 
 		 518 aa  88.2  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  32.24 
 
 		 540 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  26.16 
 
 		 562 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  25.76 
 
 		 546 aa  87.8  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>