More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1986 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  100 
 
 		 549 aa  1115    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  44.32 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  44.19 
 
 		 566 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  44.36 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  44.19 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  44.01 
 
 		 566 aa  475  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  39.82 
 
 		 563 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.57 
 
 		 584 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.89 
 
 		 599 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  41.34 
 
 		 584 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  38.49 
 
 		 579 aa  389  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  38.49 
 
 		 579 aa  389  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  36.89 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  40.88 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.47 
 
 		 576 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.17 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  34.7 
 
 		 576 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  34.99 
 
 		 578 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  34.57 
 
 		 576 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.64 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  36.25 
 
 		 578 aa  347  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  33.86 
 
 		 577 aa  347  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  33.16 
 
 		 579 aa  346  7e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  33.87 
 
 		 577 aa  345  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  34.53 
 
 		 573 aa  342  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.53 
 
 		 588 aa  340  2.9999999999999998e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  36.26 
 
 		 582 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  33.98 
 
 		 576 aa  339  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  34.69 
 
 		 591 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.88 
 
 		 578 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  35.54 
 
 		 601 aa  336  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0367  pyruvate dehydrogenase  34.52 
 
 		 579 aa  336  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 576 aa  335  9e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 573 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 576 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  34.7 
 
 		 574 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 573 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 573 aa  333  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4042  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 605 aa  333  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5572  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  34.23 
 
 		 600 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  34.22 
 
 		 574 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  34.46 
 
 		 577 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  33.69 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  33.99 
 
 		 572 aa  324  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2732  thiamine pyrophosphate protein  34.74 
 
 		 596 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  33.69 
 
 		 572 aa  323  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  33.81 
 
 		 572 aa  323  6e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  35.04 
 
 		 588 aa  323  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  35.5 
 
 		 591 aa  323  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  33.81 
 
 		 572 aa  323  6e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  33.99 
 
 		 572 aa  323  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  33.69 
 
 		 572 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  33.69 
 
 		 572 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.69 
 
 		 572 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  33.69 
 
 		 572 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  33.21 
 
 		 571 aa  322  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0936  pyruvate oxidase  34.97 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  34.98 
 
 		 582 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.45 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  33.69 
 
 		 572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  33.16 
 
 		 575 aa  319  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  32.68 
 
 		 572 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  32.68 
 
 		 601 aa  319  9e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08480  thiamine pyrophosphate protein  34.91 
 
 		 598 aa  319  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00807055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  32.38 
 
 		 572 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3196  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  32.33 
 
 		 589 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000534651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  32.32 
 
 		 573 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0856  thiamine pyrophosphate protein  34.39 
 
 		 593 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.701267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2355  thiamine pyrophosphate protein  34.74 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320889  hitchhiker  0.000848806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0068  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.45 
 
 		 596 aa  317  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.736165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0860  thiamine pyrophosphate protein  34.04 
 
 		 593 aa  317  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0808  thiamine pyrophosphate protein  33.96 
 
 		 593 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  32.8 
 
 		 572 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.46 
 
 		 529 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4440  thiamine pyrophosphate protein  32.58 
 
 		 608 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9103  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.07 
 
 		 577 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.92 
 
 		 596 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.686266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  32.56 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0784  thiamine pyrophosphate protein  34.03 
 
 		 608 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  32.62 
 
 		 572 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.91 
 
 		 572 aa  312  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  32.62 
 
 		 572 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  34.53 
 
 		 583 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0772  thiamine pyrophosphate protein  34.03 
 
 		 608 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0548988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  32.62 
 
 		 572 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  33.09 
 
 		 579 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4190  thiamine pyrophosphate protein  35.44 
 
 		 615 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0946  thiamine pyrophosphate protein  34.03 
 
 		 744 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217897  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.98 
 
 		 581 aa  310  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0287  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.27 
 
 		 597 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  31.85 
 
 		 572 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  32.38 
 
 		 573 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  32.56 
 
 		 573 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  32.56 
 
 		 573 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  33.1 
 
 		 590 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  31.85 
 
 		 573 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2979  thiamine pyrophosphate protein  33.45 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0396438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  34.71 
 
 		 589 aa  307  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 575 aa  307  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  32.38 
 
 		 573 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>