More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2703 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  78.88 
 
 		 572 aa  926    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  79.06 
 
 		 572 aa  928    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  67.6 
 
 		 572 aa  788    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  79.06 
 
 		 572 aa  927    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  67.54 
 
 		 574 aa  793    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2219  pyruvate dehydrogenase  66.37 
 
 		 572 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.372281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  79.06 
 
 		 572 aa  928    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1650  pyruvate dehydrogenase  66.02 
 
 		 572 aa  719    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  67.08 
 
 		 601 aa  782    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  100 
 
 		 573 aa  1185    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  58.71 
 
 		 578 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2302  pyruvate dehydrogenase  66.02 
 
 		 572 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  57.14 
 
 		 571 aa  665    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0699  pyruvate dehydrogenase  66.37 
 
 		 572 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  64.21 
 
 		 573 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  60.77 
 
 		 576 aa  722    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0611  pyruvate dehydrogenase  66.02 
 
 		 576 aa  720    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.69435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  91.45 
 
 		 573 aa  1081    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  64.56 
 
 		 573 aa  737    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  66.32 
 
 		 575 aa  776    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  64.21 
 
 		 573 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  61.3 
 
 		 576 aa  720    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  79.58 
 
 		 572 aa  940    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  79.58 
 
 		 572 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  65.44 
 
 		 573 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  60.28 
 
 		 577 aa  738    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4792  pyruvate dehydrogenase  64.21 
 
 		 573 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  79.41 
 
 		 572 aa  935    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  79.41 
 
 		 572 aa  937    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  78.88 
 
 		 572 aa  926    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  64.74 
 
 		 573 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  78.88 
 
 		 572 aa  926    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  99.83 
 
 		 573 aa  1183    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3376  pyruvate dehydrogenase  64.21 
 
 		 573 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  64.41 
 
 		 577 aa  736    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  58.64 
 
 		 574 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  79.06 
 
 		 572 aa  927    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  60.8 
 
 		 577 aa  717    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  60.28 
 
 		 577 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  56.92 
 
 		 578 aa  651    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  79.41 
 
 		 572 aa  937    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  78.88 
 
 		 572 aa  926    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  62.76 
 
 		 583 aa  708    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1728  pyruvate dehydrogenase  66.02 
 
 		 576 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  99.65 
 
 		 573 aa  1182    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  78.88 
 
 		 572 aa  926    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1935  pyruvate dehydrogenase  66.02 
 
 		 572 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.935279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  78.71 
 
 		 572 aa  929    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  63.26 
 
 		 575 aa  727    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  66.67 
 
 		 573 aa  760    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  61.71 
 
 		 576 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  64.74 
 
 		 573 aa  741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  52.26 
 
 		 579 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  53.08 
 
 		 578 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  49.29 
 
 		 588 aa  541  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0367  pyruvate dehydrogenase  49.3 
 
 		 579 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  48.17 
 
 		 591 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3808  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  49.21 
 
 		 582 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9103  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  50.97 
 
 		 577 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  45.71 
 
 		 579 aa  531  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  44.68 
 
 		 572 aa  526  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1010  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  43.78 
 
 		 573 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  47.23 
 
 		 582 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.69 
 
 		 578 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  43.03 
 
 		 578 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3196  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  46.9 
 
 		 589 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000534651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  47.32 
 
 		 582 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  44.13 
 
 		 572 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  46.11 
 
 		 581 aa  505  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.29 
 
 		 576 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 578 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1899  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  44.48 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3383  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.08 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  43.61 
 
 		 572 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02520  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  46.53 
 
 		 583 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  43.63 
 
 		 576 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  42.93 
 
 		 563 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 576 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2187  thiamine pyrophosphate protein central region  44.41 
 
 		 572 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7374  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  39.93 
 
 		 576 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.693349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  35.86 
 
 		 566 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  35.86 
 
 		 566 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  35.07 
 
 		 566 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.68 
 
 		 584 aa  359  6e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  35.5 
 
 		 566 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  34.7 
 
 		 566 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.45 
 
 		 549 aa  350  3e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.01 
 
 		 599 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  32.5 
 
 		 579 aa  337  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  32.5 
 
 		 579 aa  337  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  36.16 
 
 		 584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  33.87 
 
 		 579 aa  336  5.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  35.94 
 
 		 590 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  35.94 
 
 		 590 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  32.61 
 
 		 578 aa  306  5.0000000000000004e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  34.08 
 
 		 603 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  34.12 
 
 		 601 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  31.62 
 
 		 588 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6385  thiamine pyrophosphate protein  33.67 
 
 		 610 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0017  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.22 
 
 		 599 aa  296  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>