More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2201 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  95.76 
 
 		 566 aa  1108    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  94.52 
 
 		 566 aa  1092    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  100 
 
 		 566 aa  1163    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  95.23 
 
 		 566 aa  1101    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  94.52 
 
 		 566 aa  1095    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  45.58 
 
 		 579 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  45.58 
 
 		 579 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  44.52 
 
 		 579 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  46.06 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.32 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  43.93 
 
 		 584 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  43.69 
 
 		 599 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  42.78 
 
 		 584 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4042  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.73 
 
 		 605 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5572  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  42.2 
 
 		 600 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307179 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0936  pyruvate oxidase  39.63 
 
 		 586 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  39.57 
 
 		 563 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  39.68 
 
 		 601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  41.35 
 
 		 591 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  37.65 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 576 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  39.23 
 
 		 603 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.35 
 
 		 529 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.1 
 
 		 576 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0287  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.2 
 
 		 597 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  37.79 
 
 		 591 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0017  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.21 
 
 		 599 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  35.51 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0808  thiamine pyrophosphate protein  36.86 
 
 		 593 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  37.46 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2718  thiamine pyrophosphate protein  37.3 
 
 		 594 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  37.04 
 
 		 590 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4190  thiamine pyrophosphate protein  36.49 
 
 		 615 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  36.35 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  36.67 
 
 		 601 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33590  thiamine pyrophosphate protein  36.01 
 
 		 596 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0860  thiamine pyrophosphate protein  36.13 
 
 		 593 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805016  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.07 
 
 		 578 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3445  thiamine pyrophosphate protein  35.88 
 
 		 596 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663093  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  35.55 
 
 		 575 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0856  thiamine pyrophosphate protein  36.3 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.701267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.93 
 
 		 578 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4175  thiamine pyrophosphate protein  36.97 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296619  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3966  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.38 
 
 		 597 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  38.52 
 
 		 589 aa  365  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  36.43 
 
 		 572 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5492  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.23 
 
 		 597 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2732  thiamine pyrophosphate protein  35.98 
 
 		 596 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  37.81 
 
 		 577 aa  362  9e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2436  thiamine pyrophosphate protein  35.63 
 
 		 595 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262777  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  35.58 
 
 		 579 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1999  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.66 
 
 		 593 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0409327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  36.21 
 
 		 573 aa  357  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  36.41 
 
 		 572 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  35.07 
 
 		 573 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  35.07 
 
 		 573 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  35.52 
 
 		 577 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  35.52 
 
 		 577 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2355  thiamine pyrophosphate protein  35.27 
 
 		 598 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320889  hitchhiker  0.000848806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.56 
 
 		 572 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2796  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  35.52 
 
 		 597 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0268922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  35.56 
 
 		 572 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  35.38 
 
 		 572 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  34.89 
 
 		 573 aa  354  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  35.56 
 
 		 572 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  35.38 
 
 		 572 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  35.38 
 
 		 572 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2979  thiamine pyrophosphate protein  35.1 
 
 		 595 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0396438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  35.56 
 
 		 572 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  36.23 
 
 		 572 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  36.23 
 
 		 572 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  36.23 
 
 		 572 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  35.56 
 
 		 572 aa  353  4e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0367  pyruvate dehydrogenase  35.75 
 
 		 579 aa  353  5.9999999999999994e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  35.2 
 
 		 572 aa  352  7e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  35.43 
 
 		 576 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  35.25 
 
 		 576 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2966  thiamine pyrophosphate protein  35.45 
 
 		 595 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  36.04 
 
 		 572 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  36.04 
 
 		 572 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.07 
 
 		 578 aa  349  6e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  35.35 
 
 		 578 aa  349  7e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08480  thiamine pyrophosphate protein  35.87 
 
 		 598 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00807055  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6385  thiamine pyrophosphate protein  34.35 
 
 		 610 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0068  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.77 
 
 		 596 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.736165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1893  pyruvate oxidase or other thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  35.54 
 
 		 602 aa  348  2e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.68622e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.41 
 
 		 596 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.686266 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0977  pyruvate oxidase  35.4 
 
 		 606 aa  345  8.999999999999999e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.84134  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3686  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.25 
 
 		 599 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0906801  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  34.64 
 
 		 574 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.77 
 
 		 578 aa  344  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  35.83 
 
 		 577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.26 
 
 		 649 aa  342  8e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  35.51 
 
 		 583 aa  342  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4440  thiamine pyrophosphate protein  35.63 
 
 		 608 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2089  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 597 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1284  thiamine pyrophosphate protein  34.72 
 
 		 635 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283585  normal  0.383394 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0784  thiamine pyrophosphate protein  34.56 
 
 		 608 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  35.47 
 
 		 582 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0772  thiamine pyrophosphate protein  34.56 
 
 		 608 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0548988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>