More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1893 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1893  pyruvate oxidase or other thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  100 
 
 
602 aa  1244    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68622e-18 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1595  pyruvate oxidase  45.53 
 
 
603 aa  522  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0936  pyruvate oxidase  37.36 
 
 
586 aa  402  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0977  pyruvate oxidase  37.29 
 
 
606 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.84134  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  35.75 
 
 
578 aa  381  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  36.86 
 
 
566 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  36.67 
 
 
566 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  33.4 
 
 
579 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  36.48 
 
 
566 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  36.11 
 
 
566 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  33.58 
 
 
579 aa  343  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  33.58 
 
 
579 aa  343  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  35.54 
 
 
566 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.72 
 
 
549 aa  302  2e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.26 
 
 
599 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  31.8 
 
 
584 aa  296  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  30.48 
 
 
584 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4042  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.96 
 
 
605 aa  273  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33590  thiamine pyrophosphate protein  30.97 
 
 
596 aa  266  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5572  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.78 
 
 
600 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.33 
 
 
574 aa  260  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  29.91 
 
 
563 aa  257  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  30.71 
 
 
601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3445  thiamine pyrophosphate protein  30.42 
 
 
596 aa  253  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663093  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.01 
 
 
576 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  31.2 
 
 
576 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2796  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  29.04 
 
 
597 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0268922  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  30.33 
 
 
572 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.18 
 
 
591 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  30.17 
 
 
572 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  30.17 
 
 
572 aa  246  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  29.98 
 
 
572 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  30.33 
 
 
572 aa  246  8e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.17 
 
 
572 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4175  thiamine pyrophosphate protein  29.7 
 
 
593 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296619  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  30.17 
 
 
572 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  29.98 
 
 
572 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  29.26 
 
 
603 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.78 
 
 
586 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  29.98 
 
 
572 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3686  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.48 
 
 
599 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0906801  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.68 
 
 
555 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31 
 
 
581 aa  243  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  30.1 
 
 
572 aa  243  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  28.03 
 
 
576 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.77 
 
 
554 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0017  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.93 
 
 
599 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.44 
 
 
561 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  29.55 
 
 
601 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2436  thiamine pyrophosphate protein  29.42 
 
 
595 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262777  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  27.11 
 
 
577 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4190  thiamine pyrophosphate protein  28.78 
 
 
615 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  29.37 
 
 
572 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  27.11 
 
 
577 aa  242  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  29.37 
 
 
572 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  29.37 
 
 
572 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 
588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  29.37 
 
 
572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2966  thiamine pyrophosphate protein  29.42 
 
 
595 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.482904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  28.84 
 
 
572 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2979  thiamine pyrophosphate protein  29.6 
 
 
595 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0396438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08480  thiamine pyrophosphate protein  30.97 
 
 
598 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00807055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.07 
 
 
581 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0287  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.24 
 
 
597 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.69 
 
 
559 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  30.6 
 
 
591 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5492  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.87 
 
 
597 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.07 
 
 
581 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  28.76 
 
 
572 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.82 
 
 
557 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  29.54 
 
 
572 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.07 
 
 
581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3966  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.02 
 
 
597 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.26 
 
 
558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.98 
 
 
602 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  29.73 
 
 
576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  27.27 
 
 
576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  30.15 
 
 
589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  30.15 
 
 
589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2355  thiamine pyrophosphate protein  28.86 
 
 
598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320889  hitchhiker  0.000848806 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.22 
 
 
563 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.66 
 
 
561 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.14 
 
 
578 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.1 
 
 
577 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.85 
 
 
612 aa  234  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.96 
 
 
566 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2089  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.75 
 
 
597 aa  234  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  28.33 
 
 
571 aa  233  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.23 
 
 
529 aa  233  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.4 
 
 
578 aa  233  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2732  thiamine pyrophosphate protein  29.4 
 
 
596 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.14 
 
 
578 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  28.9 
 
 
572 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.55 
 
 
593 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.43 
 
 
576 aa  232  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.8 
 
 
619 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.32 
 
 
619 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.06 
 
 
632 aa  230  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  27.64 
 
 
577 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.49 
 
 
574 aa  230  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>