More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0977 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0977  pyruvate oxidase  100 
 
 		 606 aa  1247    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.84134  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1595  pyruvate oxidase  37.27 
 
 		 603 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0936  pyruvate oxidase  37.52 
 
 		 586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1893  pyruvate oxidase or other thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  37.29 
 
 		 602 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.68622e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  36.5 
 
 		 566 aa  349  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  36.31 
 
 		 566 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  35.4 
 
 		 566 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  35.4 
 
 		 566 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  35.58 
 
 		 566 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  33.67 
 
 		 578 aa  331  2e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  34.09 
 
 		 579 aa  320  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  34.09 
 
 		 579 aa  320  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  33.08 
 
 		 579 aa  307  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  32.34 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  30.99 
 
 		 584 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.57 
 
 		 549 aa  270  7e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  31.06 
 
 		 584 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  30.34 
 
 		 599 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  30.91 
 
 		 572 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  30.73 
 
 		 572 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  30.73 
 
 		 572 aa  263  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  30.73 
 
 		 572 aa  263  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  30.73 
 
 		 572 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  30.44 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  32.08 
 
 		 576 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  30.83 
 
 		 572 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  31.65 
 
 		 576 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  31.33 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  31.03 
 
 		 572 aa  256  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.49 
 
 		 572 aa  256  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  30.49 
 
 		 572 aa  256  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  30.49 
 
 		 572 aa  256  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  30.49 
 
 		 572 aa  256  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  30.49 
 
 		 572 aa  256  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  30.49 
 
 		 572 aa  256  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  30.31 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  30.31 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  31.8 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  31.64 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  30.13 
 
 		 572 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  31.62 
 
 		 573 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  29.54 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5572  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.09 
 
 		 600 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  29.36 
 
 		 577 aa  250  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  30.51 
 
 		 563 aa  249  8e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4042  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  30.08 
 
 		 574 aa  248  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.61 
 
 		 588 aa  248  3e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.42 
 
 		 572 aa  246  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  31.33 
 
 		 573 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  28.52 
 
 		 575 aa  243  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  29.69 
 
 		 590 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.58 
 
 		 576 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  30.04 
 
 		 576 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.04 
 
 		 575 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  30.25 
 
 		 571 aa  240  6.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  29.5 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  29.69 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  29.69 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  29.72 
 
 		 573 aa  239  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.02 
 
 		 574 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.77 
 
 		 578 aa  236  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  31.9 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  29.39 
 
 		 573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2355  thiamine pyrophosphate protein  30.65 
 
 		 598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320889  hitchhiker  0.000848806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  29.67 
 
 		 573 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  29.23 
 
 		 573 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  31.72 
 
 		 582 aa  234  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  29.66 
 
 		 579 aa  233  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1930  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 529 aa  234  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4792  pyruvate dehydrogenase  29.3 
 
 		 573 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  28.3 
 
 		 572 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3376  pyruvate dehydrogenase  29.3 
 
 		 573 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.72 
 
 		 589 aa  231  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  29 
 
 		 577 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  30.49 
 
 		 591 aa  230  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08480  thiamine pyrophosphate protein  31.46 
 
 		 598 aa  230  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00807055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.07 
 
 		 578 aa  229  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7374  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.31 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.693349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3966  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.18 
 
 		 597 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  27.97 
 
 		 572 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2436  thiamine pyrophosphate protein  30.24 
 
 		 595 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262777  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3445  thiamine pyrophosphate protein  28.07 
 
 		 596 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663093  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2979  thiamine pyrophosphate protein  29.79 
 
 		 595 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0396438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.26 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6385  thiamine pyrophosphate protein  30.65 
 
 		 610 aa  224  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3238  thiamine pyrophosphate protein central region  28 
 
 		 614 aa  223  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  28.65 
 
 		 601 aa  223  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6220  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.41 
 
 		 596 aa  223  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863586  normal  0.0472829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2966  thiamine pyrophosphate protein  29.6 
 
 		 595 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482904 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.16 
 
 		 576 aa  221  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33590  thiamine pyrophosphate protein  28.07 
 
 		 596 aa  220  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  28.62 
 
 		 603 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1284  thiamine pyrophosphate protein  30.98 
 
 		 635 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283585  normal  0.383394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.94 
 
 		 563 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.98 
 
 		 559 aa  217  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5492  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 597 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  29.29 
 
 		 583 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  31.02 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2732  thiamine pyrophosphate protein  30.21 
 
 		 596 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>