More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  54.75 
 
 		 576 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3808  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  63.72 
 
 		 582 aa  728    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  100 
 
 		 578 aa  1173    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  55.44 
 
 		 574 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0367  pyruvate dehydrogenase  64.24 
 
 		 579 aa  721    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  64.43 
 
 		 591 aa  750    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  59.28 
 
 		 582 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3196  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  62.74 
 
 		 589 aa  701    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000534651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  59.08 
 
 		 582 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9103  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  65.74 
 
 		 577 aa  724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  54.75 
 
 		 576 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02520  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  58.76 
 
 		 583 aa  627  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  53.54 
 
 		 576 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  52.08 
 
 		 577 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  52.08 
 
 		 577 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  55.57 
 
 		 577 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  53.22 
 
 		 574 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  51.05 
 
 		 572 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  52.63 
 
 		 572 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  53.08 
 
 		 573 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  53.08 
 
 		 573 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  53.08 
 
 		 573 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  52.19 
 
 		 572 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  52.9 
 
 		 573 aa  594  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  52.89 
 
 		 573 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  52.19 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  52.19 
 
 		 572 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  52.19 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  52.78 
 
 		 577 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  52.62 
 
 		 572 aa  589  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  51.84 
 
 		 572 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  52.01 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  50.79 
 
 		 601 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  52.01 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  51.66 
 
 		 572 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  52.17 
 
 		 573 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  51.84 
 
 		 572 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  51.84 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  48.17 
 
 		 579 aa  588  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  52.01 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  52.19 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  52.01 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  51.38 
 
 		 573 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4792  pyruvate dehydrogenase  52.17 
 
 		 573 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  52 
 
 		 573 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3376  pyruvate dehydrogenase  52.17 
 
 		 573 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.36 
 
 		 575 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  52 
 
 		 573 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  51.65 
 
 		 573 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  51.66 
 
 		 575 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  50.09 
 
 		 573 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  50.09 
 
 		 571 aa  565  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  52.28 
 
 		 578 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  50.09 
 
 		 578 aa  557  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  45.98 
 
 		 578 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.63 
 
 		 578 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  51.58 
 
 		 583 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0699  pyruvate dehydrogenase  52.94 
 
 		 572 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2219  pyruvate dehydrogenase  52.94 
 
 		 572 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.372281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1650  pyruvate dehydrogenase  52.77 
 
 		 572 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2302  pyruvate dehydrogenase  52.94 
 
 		 572 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 578 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0611  pyruvate dehydrogenase  52.77 
 
 		 576 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.69435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1728  pyruvate dehydrogenase  52.77 
 
 		 576 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1935  pyruvate dehydrogenase  52.77 
 
 		 572 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.935279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  49.66 
 
 		 588 aa  534  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  46.25 
 
 		 581 aa  529  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  49.21 
 
 		 579 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 576 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.74 
 
 		 576 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  43.35 
 
 		 572 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  41.71 
 
 		 563 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  43.76 
 
 		 572 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1010  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  41.7 
 
 		 573 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  43.43 
 
 		 572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.75 
 
 		 576 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1899  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  40.7 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7374  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  43.92 
 
 		 576 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.693349 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3383  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 571 aa  428  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2187  thiamine pyrophosphate protein central region  41.84 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.25 
 
 		 549 aa  372  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.5 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  35.41 
 
 		 566 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  35.35 
 
 		 566 aa  363  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  34.52 
 
 		 566 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  34.7 
 
 		 566 aa  360  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  35.17 
 
 		 566 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.25 
 
 		 599 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  32.11 
 
 		 579 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  32.11 
 
 		 579 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  35.6 
 
 		 584 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  32.3 
 
 		 579 aa  330  6e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  32.01 
 
 		 578 aa  314  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0017  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.02 
 
 		 599 aa  307  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  35.26 
 
 		 590 aa  299  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  33.57 
 
 		 588 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  34.91 
 
 		 590 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6569  thiamine pyrophosphate protein  34.8 
 
 		 608 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2966  thiamine pyrophosphate protein  33.33 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482904 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6283  thiamine pyrophosphate protein  34.62 
 
 		 608 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.368758  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>