More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1010 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3383  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  59.3 
 
 		 571 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1010  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 573 aa  1191    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  57.12 
 
 		 572 aa  689    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  57.87 
 
 		 572 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  57.69 
 
 		 572 aa  653    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1899  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  52.11 
 
 		 570 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.62 
 
 		 576 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2187  thiamine pyrophosphate protein central region  51.14 
 
 		 572 aa  551  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  49.91 
 
 		 578 aa  544  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  45.85 
 
 		 577 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  45.85 
 
 		 577 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  45.74 
 
 		 576 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  46.71 
 
 		 577 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  44.12 
 
 		 576 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  44.99 
 
 		 573 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  44.52 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  47.05 
 
 		 583 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  45.34 
 
 		 578 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  43.78 
 
 		 573 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  43.78 
 
 		 573 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  43.16 
 
 		 572 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  43.71 
 
 		 601 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  43.78 
 
 		 573 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  42.36 
 
 		 572 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  44.04 
 
 		 574 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  42.18 
 
 		 572 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  42.18 
 
 		 572 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  42.18 
 
 		 572 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  43.05 
 
 		 577 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  42.18 
 
 		 572 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  42.18 
 
 		 574 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  41.99 
 
 		 572 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  43.25 
 
 		 571 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  41.64 
 
 		 572 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  41.46 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  41.64 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  41.46 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  43.2 
 
 		 575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  41.46 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  41.64 
 
 		 572 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  41.64 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  41.64 
 
 		 572 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  42.71 
 
 		 573 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  41.67 
 
 		 572 aa  468  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.15 
 
 		 575 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  42.18 
 
 		 573 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  41.51 
 
 		 573 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  41.73 
 
 		 573 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  41.33 
 
 		 573 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  41.55 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  42.25 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4792  pyruvate dehydrogenase  41.33 
 
 		 573 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3376  pyruvate dehydrogenase  41.33 
 
 		 573 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  42.14 
 
 		 591 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  42.31 
 
 		 579 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  39.72 
 
 		 579 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0611  pyruvate dehydrogenase  42.88 
 
 		 576 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.69435  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1650  pyruvate dehydrogenase  42.88 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  39.12 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2302  pyruvate dehydrogenase  43.28 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1728  pyruvate dehydrogenase  42.88 
 
 		 576 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1935  pyruvate dehydrogenase  42.88 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.935279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 578 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0699  pyruvate dehydrogenase  42.88 
 
 		 572 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2219  pyruvate dehydrogenase  42.88 
 
 		 572 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.372281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  41.7 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.95 
 
 		 578 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  41.9 
 
 		 588 aa  428  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40.39 
 
 		 581 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  40.31 
 
 		 582 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0367  pyruvate dehydrogenase  40.7 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3808  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.23 
 
 		 582 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9103  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  41.84 
 
 		 577 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  38.92 
 
 		 582 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3196  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.38 
 
 		 589 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000534651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  39.79 
 
 		 576 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02520  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  40.83 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  36.94 
 
 		 563 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.46 
 
 		 576 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7374  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  37.59 
 
 		 576 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.693349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  34.96 
 
 		 566 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  34.48 
 
 		 566 aa  319  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  34.66 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  34.14 
 
 		 584 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  34.48 
 
 		 566 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  34.3 
 
 		 566 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  34.26 
 
 		 584 aa  293  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.45 
 
 		 549 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  32.19 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6385  thiamine pyrophosphate protein  31.9 
 
 		 610 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  30.51 
 
 		 603 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  31.45 
 
 		 588 aa  257  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6147  thiamine pyrophosphate protein  33.51 
 
 		 612 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0509796  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1291  thiamine pyrophosphate protein  33.33 
 
 		 611 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6540  thiamine pyrophosphate protein  33.33 
 
 		 611 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.230604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0946  thiamine pyrophosphate protein  32.92 
 
 		 744 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217897  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0784  thiamine pyrophosphate protein  32.92 
 
 		 608 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6569  thiamine pyrophosphate protein  34.04 
 
 		 608 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0772  thiamine pyrophosphate protein  32.92 
 
 		 608 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0548988  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6283  thiamine pyrophosphate protein  33.51 
 
 		 608 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.368758  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>