More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2294 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2031  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  97.75 
 
 		 578 aa  1184    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  60.69 
 
 		 581 aa  759    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  98.1 
 
 		 578 aa  1187    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401078  normal  0.110885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2249  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  57.09 
 
 		 579 aa  696    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0404885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 578 aa  1206    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  47.12 
 
 		 574 aa  541  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0367  pyruvate dehydrogenase  46.61 
 
 		 579 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01410  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  46.19 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22790  pyruvate dehydrogenase  45.63 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.998017  normal  0.640022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  44.5 
 
 		 576 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  44.23 
 
 		 576 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0214  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.15 
 
 		 588 aa  511  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1843  pyruvate dehydrogenase  42.86 
 
 		 577 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528367  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1564  pyruvate dehydrogenase  42.68 
 
 		 577 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48094  normal  0.707647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3808  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  46.13 
 
 		 582 aa  504  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  43.38 
 
 		 601 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  43.38 
 
 		 572 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  42.66 
 
 		 574 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1677  pyruvate dehydrogenase  43.55 
 
 		 577 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.50308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0590  pyruvate dehydrogenase  45.21 
 
 		 582 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0720  pyruvate dehydrogenase  45.21 
 
 		 582 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3196  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  45.3 
 
 		 589 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000534651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1589  pyruvate dehydrogenase  42.86 
 
 		 573 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9103  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  46.15 
 
 		 577 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0892  pyruvate dehydrogenase  43.01 
 
 		 576 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2619  pyruvate dehydrogenase  42.86 
 
 		 573 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  43.11 
 
 		 573 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  42.63 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2703  pyruvate dehydrogenase  42.86 
 
 		 573 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  42.46 
 
 		 572 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  43.35 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  42.98 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  42.46 
 
 		 572 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3833  pyruvate dehydrogenase  45.33 
 
 		 583 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  42.63 
 
 		 572 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  42.46 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  42.63 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  42.46 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  42.63 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  42.63 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  42.63 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  42.46 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03967  pyruvate dehydrogenase  41.26 
 
 		 575 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  42.63 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  42.63 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  43.11 
 
 		 578 aa  481  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1664  pyruvate dehydrogenase  42.51 
 
 		 573 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265267  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2816  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  43.53 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  42.76 
 
 		 578 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4864  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.61 
 
 		 575 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.662059  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  42.21 
 
 		 573 aa  475  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  41.36 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  41.43 
 
 		 573 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5157  pyruvate dehydrogenase  41.36 
 
 		 573 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02520  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  44.97 
 
 		 583 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4140  pyruvate dehydrogenase  41.26 
 
 		 573 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2858  pyruvate dehydrogenase  41.26 
 
 		 573 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2302  pyruvate dehydrogenase  42.86 
 
 		 572 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4792  pyruvate dehydrogenase  41.26 
 
 		 573 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  41.43 
 
 		 573 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3376  pyruvate dehydrogenase  41.26 
 
 		 573 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2219  pyruvate dehydrogenase  42.68 
 
 		 572 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.372281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1935  pyruvate dehydrogenase  42.51 
 
 		 572 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.935279  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1650  pyruvate dehydrogenase  42.51 
 
 		 572 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0699  pyruvate dehydrogenase  42.68 
 
 		 572 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0611  pyruvate dehydrogenase  42.51 
 
 		 576 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.69435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1728  pyruvate dehydrogenase  42.51 
 
 		 576 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0284  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  40.41 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69925  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  39.86 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  39.05 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1010  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  38.6 
 
 		 573 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  41.23 
 
 		 576 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0553  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.21 
 
 		 576 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6071  pyruvate dehydrogenase  39.86 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3372  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.68 
 
 		 576 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7374  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  41.45 
 
 		 576 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.693349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  37.97 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1899  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  36.96 
 
 		 570 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3383  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.48 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2187  thiamine pyrophosphate protein central region  38.51 
 
 		 572 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  35.46 
 
 		 566 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  34.93 
 
 		 566 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  34.88 
 
 		 566 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.17 
 
 		 549 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  34.93 
 
 		 566 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  34.71 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  33.33 
 
 		 584 aa  332  8e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  31.02 
 
 		 579 aa  302  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  31.02 
 
 		 579 aa  302  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  31.75 
 
 		 584 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.69 
 
 		 599 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0017  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.41 
 
 		 599 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  30.47 
 
 		 579 aa  281  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  31.72 
 
 		 601 aa  280  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2966  thiamine pyrophosphate protein  32.17 
 
 		 595 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0287  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.42 
 
 		 597 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2436  thiamine pyrophosphate protein  32 
 
 		 595 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262777  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2732  thiamine pyrophosphate protein  32.87 
 
 		 596 aa  277  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2355  thiamine pyrophosphate protein  32.3 
 
 		 598 aa  276  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320889  hitchhiker  0.000848806 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  30.59 
 
 		 578 aa  274  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>